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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003546`

染色体: Chr08 坐标: 38088682-38091559 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003546`
名称	SmilChr08G003546
描述	uncharacterized SmilChr08G003546
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	38088682 - 38091559 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996660`
GeneID	`130996660`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996660`
原始查询	`SmilChr08G003546`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820320]; symbol=AT3G11470; hit=AT3G11470; species=arabidopsis; confidence=high
产物	4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820320]; symbol=AT3G11470; hit=AT3G11470; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G11470` (AT3G11470) 4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820320] identity=55.2; qcov=0.925; evalue=1.73e-113; confidence=high
Rice	`Os08g0243100` - identity=51.8; qcov=0.884; evalue=2.67e-96; confidence=high
GO	GO:0000287 (magnesium ion binding); GO:0005829 (cytosol); GO:0008897 (holo-[acyl-carrier-protein] synthase activity); GO:0019878 (GO:0019878)
KEGG	smil00770 (Pantothenate and CoA biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01648 (ACPS); PF22624 (AASDHPPT_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996660

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057777940.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.80000	`XP_057777940.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777940.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777940.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777940.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:38088915`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C69,D4
`Chr8:38088942`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C69,D4
`Chr8:38088960`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:38089057`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B134,B2,D7
`Chr8:38089566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:38089755`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:38089756`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:38089816`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B33,B56,B96,D4
`Chr8:38090050`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,C1,C50,D11
`Chr8:38090079`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:38090193`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr8:38090725`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B101,B17

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777940.1

319 aa

160

319

AASDHPPT_N

ACPS

PF22624 AASDHPPT_N 50-139 aa PF01648 ACPS 148-229 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777940.1`	Pfam	`PF22624`	AASDHPPT_N	Domain	50	139	4.8e-07	30.7	4'-phosphopantetheinyl transferase, N-terminal
`XP_057777940.1`	Pfam	`PF01648`	ACPS	Domain	148	229	2.2e-17	63.8	4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921957.1
GGCCCAACTTTGATAAGTAAAATCAAGCCCACACTAAAAACTCTCTCTCTTTTCTCTCTCTCATATACAATCGGTCATTCGGTCTCCTCTCTCTCCTCGTATCTCTCACTCTCTCAATCTCACAGATACGCACATACATCCCCCACCGCTTCCTCCTCCGGCGAAGGGCGCCGTCCTCGACCACCTACGCCACAGGCATCTCGTCCGTCTCACCTCACGCTCCCCTGTCTACCCCTTTCTATCACTCAGCGCGCACGGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996660
ATGCGGAGAGGGTTTTCGAGAATGAAGTTGCATTGCCTCGATAGAACACTCTTCCGTTCTTCGCATTCTTTAAATGGCGTTCATCTCCCTGCTCCAATGGAGACGCATTTGTGGTATGTGAAGCCCAGCGAAGTGAAGAGTGAGTCTTTGCTAAAGCAGTACTTTGATATTCTGTCGCCGTGTGAGCGGGAGAATGTTTTGCGGTTGCAAGGAGAGGAGCTGAGGAAGAGCGCGTTGCTGGCACGTGCATTGGTTCGCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777940.1
MRRGFSRMKLHCLDRTLFRSSHSLNGVHLPAPMETHLWYVKPSEVKSESLLKQYFDILSPCERENVLRLQGEELRKSALLARALVRTTIAKYQMNSPVDPRSLKFRKNMHGKPEVCWPSMDDWDPPPLHFNLSHTSSLIACGVTVNSQIGIDVEEKQRSTKHDILSFARRYFSKYEVQLLAAVSDPQAQQREFIKLWTLKEAYVKALGKGFSGAPFKTFTIRFRAVMEGGFKALDESSTKGYEIIVDSVDDPTNVTTSWQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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