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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003550`

染色体: Chr08 坐标: 38124013-38126419 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003550`
名称	SmilChr08G003550
描述	rho GTPase-activating protein 5-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	38124013 - 38126419 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996662`
GeneID	`130996662`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996662`
原始查询	`SmilChr08G003550`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rho GTPase-activating protein 5-like
产物	rho GTPase-activating protein 5-like
Arabidopsis	`AT5G22400` (AT5G22400) Rho GTPase activating protein with PAK-box/P21-Rho-binding domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832301] identity=77.3; qcov=0.67; evalue=3.52e-147; confidence=high
Rice	`Os11g0153400` - identity=72.9; qcov=0.637; evalue=2.14e-131; confidence=high
GO	GO:0005096 (GTPase activator activity); GO:0007165 (signal transduction)
KEGG	-
Pfam	PF00620 (RhoGAP); PF00786 (PBD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996662

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057777943.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057777943.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777943.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777943.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777943.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:38124343`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr8:38124586`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	76	A1,A14,A16,A20,A5,A7,B101,B102,B106,B108,B113,B124,B125,B129,B130,B135,B136,B138,B14,B18,B2,B21,B22,B23,B27,B28,B32,B34,B38,B41,B42,B45,B51,B57,B59,B60,B65,B74,B76,B77,B78,B80,B87,B88,B9,B94,B95,B98,C1,C18,C19,C22,C23,C24,C28,C31,C32,C37,C39,C42,C43,C48,C50,C51,C56,C6,C64,C67,C72,C74,C8,C82,C86,D1,D11,D2
`Chr8:38124591`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	106	A1,A14,A16,A18,A20,A22,A3,A5,A7,B101,B102,B103,B106,B108,B110,B111,B112,B113,B120,B124,B125,B129,B130,B135,B136,B138,B14,B17,B18,B2,B21,B22,B23,B26,B27,B28,B32,B33,B34,B38,B41,B42,B45,B46,B47,B5,B51,B57,B59,B60,B64,B65,B74,B76,B77,B78,B80,B87,B88,B9,B90,B94,B95,B98,C1,C14,C17,C18,C19,C20,C22,C23,C24,C28,C31,C32,C34,C37,C42,C43,C48,C5,C50,C51,C56,C57,C6,C62,C63,C64,C67,C70,C72,C74,C75,C77,C79,C8,C80,C84,C86,C9,D1,D11,D2,D5
`Chr8:38124726`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr8:38124765`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr8:38124805`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	234	A1,A10,A14,A15,A16,A18,A19,A20,A21,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B111,B112,B113,B114,B117,B118,B119,B12,B120,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B16,B17,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B32,B33,B34,B35,B37,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B59,B6,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B89,B9,B90,B91,B92,B94,B95,B96,B97,B98,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C9,D1,D10,D11,D3,D4,D5,D6,D7,D8
`Chr8:38124820`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	226	A1,A10,A14,A15,A16,A18,A19,A20,A21,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B11,B111,B112,B113,B114,B117,B118,B119,B12,B120,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B16,B17,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B32,B33,B34,B35,B37,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B59,B6,B61,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B70,B71,B72,B73,B74,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B89,B9,B90,B91,B92,B94,B95,B96,B97,B98,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C27,C28,C29,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C75,C76,C77,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C9,D1,D10,D3,D4,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr8:38124831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,C11
`Chr8:38124834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,C11
`Chr8:38124858`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C39,C79
`Chr8:38124870`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,C39,C79
`Chr8:38124876`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,C39,C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777943.1

394 aa

197

394

PBD

RhoGAP

PF00786 PBD 58-85 aa PF00620 RhoGAP 121-255 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777943.1`	Pfam	`PF00786`	PBD	Domain	58	85	2e-05	25.5	P21-Rho-binding domain
`XP_057777943.1`	Pfam	`PF00620`	RhoGAP	Domain	121	255	6.9e-24	85.1	RhoGAP domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921960.1
AAAATATATACGTTATGGCATAAAAAATAAAGTGCAGATAAAGCATGAGGAAAATTACATAAATGATGATGTACAAGTCCCACCTTCCACAAAAACTTTACTTGAATCAAACTCTACTCAACAATTCTCTCTCTCTCTCAAAAAATAATTGTCTTGTTCTTACACCATTAATCCACCCATCCACCACCAACCCCGTAATCATTAAGCTGCAGTTTTTACACAAAAACAAGAGACTAATTAATCCACCCCAACTACCAAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996662
ATGACAGAGATACTACGTTCCCCGCCCCAACAACTGCCATCCACCTCCATCTCTGTTGATGGCATAGGCGAAGGGGATCAGGTGCCTGTTTTGGCTGTTTTCTTGACTGTGTTTAGGAAATCTTTGGTGGGTTGCAGAAGCAGGTCTGGGGTTCAAGAACAGGCCATAATGGAGATTGGCTGCCCTACCAATGTTAGGCATGTTGCTCATGTTACCTTTGATAGGTTTAATGGCTTTCTTGGCCTTCCTGTTGAGTTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777943.1
MTEILRSPPQQLPSTSISVDGIGEGDQVPVLAVFLTVFRKSLVGCRSRSGVQEQAIMEIGCPTNVRHVAHVTFDRFNGFLGLPVEFEPEVPRRPPSASTRVFGVSTESMQLSFDGRGNCVPTILLMMQRRLYSQRGLQSEGIFRINPENGQEEYVREQLNNGLIPDDIDVHCLAGLIKAWFRELPKGVLDSLEAEQVMQAQTEEECAQLVSLLPPTEAALLDWAINLMTDVAQFEHLNKMNARNIAMVFAPNMTQMSDPL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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