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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003554`

染色体: Chr08 坐标: 38199163-38201868 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003554`
名称	SmilChr08G003554
描述	caffeoylshikimate esterase-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	38199163 - 38201868 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996666`
GeneID	`130996666`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996666`
原始查询	`SmilChr08G003554`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	caffeoylshikimate esterase-like
产物	caffeoylshikimate esterase-like
Arabidopsis	`AT2G39420` (AT2G39420) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818527] identity=61.4; qcov=0.997; evalue=2.4e-150; confidence=high
Rice	`Os12g0262700` - identity=58; qcov=0.939; evalue=3.96e-134; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0016298 (lipase activity)
KEGG	smil00940 (Phenylpropanoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00561 (Abhydrolase_1); PF12146 (Hydrolase_4); PF12697 (Abhydrolase_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996666

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057777948.1`
2	Lipid droplet	脂滴	0.80000	`XP_057777948.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057777948.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057777948.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777948.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:38199799`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr8:38199816`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C73
`Chr8:38199927`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B122,B14,B93,C38
`Chr8:38200185`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	20	A20,A24,A9,B108,B109,B131,B25,B30,B60,B64,B67,B91,B93,C28,C3,C38,C58,C62,C68,C79
`Chr8:38200189`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	19	A20,A24,A9,B108,B109,B131,B25,B30,B64,B67,B91,B93,C28,C3,C38,C58,C62,C68,C79
`Chr8:38200241`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B109,B131,C68
`Chr8:38201123`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B66,B8
`Chr8:38201343`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr8:38201426`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C73
`Chr8:38201565`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777948.1

312 aa

156

312

Hydrolase_4

Abhydrolase_1

Abhydrolase_6

PF12146 Hydrolase_4 34-271 aa PF00561 Abhydrolase_1 38-231 aa PF12697 Abhydrolase_6 39-271 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777948.1`	Pfam	`PF12146`	Hydrolase_4	Domain	34	271	3.5e-62	210.6	Serine aminopeptidase, S33
`XP_057777948.1`	Pfam	`PF00561`	Abhydrolase_1	Domain	38	231	1e-13	52.3	alpha/beta hydrolase fold
`XP_057777948.1`	Pfam	`PF12697`	Abhydrolase_6	Domain	39	271	6.2e-12	47.3	Alpha/beta hydrolase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921965.1
CAATAGGAAAGAATTAGCCGTCGATTTAGACGTCTCGATCAAGTTCGTATCCGTTCCATAAATAGCCAACCAAATACGAACTCCACTCCTCATCACCTTCATCTCAATCTCTCTGTTTTTCATATTTCCCACACACGAATTCTTTTCAGAGAAACAAAAAAATCTATCATTTTTTGCTCTTTTTCCTTTACATACGAATGGAAACCGCGAACAGCAACGTCATATATGAAGAGAAATTCATAGTGAGACCACGTGGAGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996666
ATGGAAACCGCGAACAGCAACGTCATATATGAAGAGAAATTCATAGTGAGACCACGTGGAGTGAAGCTATTCACCTGCCGATGGGCGCCTGCAGATAAAGAGGCAAAAGCTCTGGTTTTCCTCTGCCATGGCTACGCCATGGAGTGTAGCATCTCCATGAGAGGCTGCGCCGCTCGACTAGTGGAGGCGGGGTATGAAGTCCACGGCATCGACTGCGAAGGCCATGGGAAATCCTCCGGCCTGCTCGGACTCATCACCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777948.1
METANSNVIYEEKFIVRPRGVKLFTCRWAPADKEAKALVFLCHGYAMECSISMRGCAARLVEAGYEVHGIDCEGHGKSSGLLGLITSFDDLVDDLSDHFTNISERKENRNKLRILMGESMGGAMVLRLHRKMPDFWDGAVLVAPMCKIADDIKPSPVVITILTALARIIPTWKLTPTPDIIDIAFRDPQVRQEVRSNAYTYKGRPRLQTSYQLYTVSTDLEKRLEEVSLPFIVLHGEEDKVTDPSVSKTLHETARAADKT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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