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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003559`

染色体: Chr08 坐标: 38266321-38267650 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003559`
名称	SmilChr08G003559
描述	uncharacterized SmilChr08G003559
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	38266321 - 38267650 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996671`
GeneID	`130996671`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996671`
原始查询	`SmilChr08G003559`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0844700; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0844700; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G24490` (ALB4) OxaA/YidC-like membrane insertion protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839065] identity=89.5; qcov=0.17; evalue=5.49e-06; confidence=weak
Rice	`Os03g0844700` - identity=51.2; qcov=0.384; evalue=1.02e-06; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996671

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057777953.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057777953.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057777953.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777953.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777953.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:38266414`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:38266591`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr8:38267189`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	38	A1,A25,A9,B1,B102,B104,B111,B12,B133,B136,B139,B21,B22,B25,B36,B4,B41,B50,B52,B55,B60,B69,B74,B77,B87,B97,B98,C14,C17,C20,C28,C38,C40,C5,C72,C74,D8,D9
`Chr8:38267216`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B21,C50,D9
`Chr8:38267220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921970.1
TAAAACCTCATCAATGTATTTGGTTCAGCTACATAAATTTTCTTACTTGTTACATTAAAAGGTTAGGAGGCAAGGAGTACTTTGTTCTTAAAGACATAATGACATTTCTCCCTCTAGAATTTACTTCTTAATTTCTTATTCAGTTGTGAATTATTCCTCTCTTTCCATTTGTCTTAGGAAGTCTTCCTACACTTGCCACTATCCCCATATATATTGGGTTTTATAGAGCTCTTTCTAATACAGCAGATGAGCGATTGTTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996671
ATGGAAGGCTTCTTCTGGATACCCTCACTATCTGGTCCGACAACTGTTGCTGCTAGGAAAACTCTGGCAGTGGTACCCCTTGGCTTTTCCTCTACATTGTTTAAACAAAGAGAGGAAGAGATGAGGAAAGCTGAGGAGGCAGCAACTAATGGGCTTCAGATTACAAATTGCAAAGTAAATAAAGAAATGACTCTACTCGAGGGACATACTAGTTCTTCTAACATTGATGGCTTTGCTGTGAACGGTAATGAAGTAAACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777953.1
MEGFFWIPSLSGPTTVAARKTLAVVPLGFSSTLFKQREEEMRKAEEAATNGLQITNCKVNKEMTLLEGHTSSSNIDGFAVNGNEVNSELKDNERSSADREETPDKSDDEDGS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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