当前解析结果
SmilChr08G003562| 统一基因 ID | SmilChr08G003562 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G003562 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G003562 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 38306530 - 38306937 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130998447 |
|---|---|
| GeneID | 130998447 |
| locus_tag | - |
| NCBI 名称 | LOC130998447 |
| 原始查询 | SmilChr08G003562 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low |
| 拟南芥 | -- |
| 水稻 | Os12g0597300- identity=37.63; qcov=0.689; evalue=7.88e-14; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998447 |
预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。
当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。 四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。
| 排序 | 定位位置 | 预测得分 | 蛋白 ID |
|---|---|---|---|
| 1 | 细胞核 | 1.00000 | XP_057779845.1 |
| 2 | 细胞质 | 0.20000 | XP_057779845.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | 参考等位基因 | 变异等位基因 | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:38306554 |
A |
AT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 5 | C11,C51,C63,C69,D4 |
Chr8:38306554 |
A |
AT |
1bp_insertion | CDS_variant | 5 | C11,C51,C63,C69,D4 |
Chr8:38306585 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C59,D11 |
Chr8:38306604 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 15 | B10,B137,B18,B20,B63,B66,B76,B8,B86,B88,C18,C44,C51,C57,C86 |
Chr8:38306655 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B26,C77 |
Chr8:38306691 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 5 | C11,C51,C63,C69,D4 |
Chr8:38306691 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | C11,C51,C63,C69,D4 |
Chr8:38306709 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B74,C73 |
Chr8:38306724 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 168 | A1,A10,A11,A16,A18,A19,A23,A24,A25,A3,A6,A8,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B105,B106,B107,B11,B110,B112,B113,B115,B117,B118,B119,B120,B121,B126,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B134,B137,B138,B17,B18,B2,B20,B21,B22,B23,B27,B29,B3,B30,B31,B34,B36,B37,B38,B39,B40,B41,B42,B43,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B57,B6,B60,B63,B64,B66,B67,B68,B69,B7,B71,B72,B74,B75,B77,B78,B79,B8,B81,B83,B84,B86,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B98,B99,C10,C11,C12,C16,C18,C19,C20,C26,C28,C29,C3,C30,C32,C33,C34,C35,C38,C39,C40,C41,C43,C44,C45,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C56,C57,C58,C59,C6,C61,C63,C64,C65,C66,C68,C69,C7,C70,C72,C73,C76,C77,C79,C80,C81,C83,C84,C85,C86,C87,D1,D11,D3,D4,D5,D8 |
Chr8:38306753 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B1,B101,B134,B22,C79 |
Chr8:38306767 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 14 | A15,A18,A22,B125,B23,B4,B72,C16,C21,C36,C5,C53,C67,C9 |
Chr8:38306768 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 169 | A1,A10,A11,A16,A19,A21,A23,A24,A25,A3,A6,A8,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B105,B106,B107,B109,B11,B110,B112,B113,B115,B117,B118,B119,B120,B121,B126,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B137,B138,B139,B17,B18,B2,B20,B21,B22,B27,B29,B3,B30,B31,B34,B36,B37,B38,B39,B40,B41,B42,B43,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B57,B6,B60,B63,B64,B66,B67,B68,B69,B7,B71,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B98,B99,C10,C11,C12,C18,C19,C20,C26,C28,C29,C3,C30,C32,C33,C34,C35,C38,C39,C40,C41,C43,C44,C45,C47,C48,C49,C50,C51,C52,C54,C56,C57,C58,C59,C6,C61,C63,C64,C65,C66,C68,C69,C7,C70,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C80,C81,C83,C84,C85,C86,C87,D1,D11,D3,D4,D5,D8 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。