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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003574`

染色体: Chr08 坐标: 38474514-38480414 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003574`
名称	SmilChr08G003574
描述	uncharacterized SmilChr08G003574
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	38474514 - 38480414 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998450`
GeneID	`130998450`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998450`
原始查询	`SmilChr08G003574`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0946800; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os01g0946800; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os01g0946800` - identity=25.6; qcov=0.238; evalue=4.09e-10; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998450

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779848.1`
2	Chromosome	染色体	0.60000	`XP_057779848.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057779848.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779848.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779848.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:38475981`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C19,C82
`Chr8:38476232`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,C48,C51
`Chr8:38476329`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B61,C1
`Chr8:38476486`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B127,B128,C64
`Chr8:38476559`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr8:38476621`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B108
`Chr8:38476621`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B108
`Chr8:38476848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,B50,C20
`Chr8:38476884`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B131,C16
`Chr8:38477123`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr8:38477157`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,C87
`Chr8:38477178`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B99

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779848.1

920 aa

460

920

DUF8566

PF29561 DUF8566 205-407 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779848.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	205	407	3.7e-53	181.0	Domain of unknown function (DUF8566)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923865.1
ATTCCCGGCGCTGAAATGTAATGATCCAATTTACCTCCAATTTTCACTTTTATTCACGCGGTAAGTGAACTAGAATAGTCAAAAATCGGCTTCTGAAAATTACCGTCTGCAGTTCTGAAAATAGATCTAGGGTTTTTACTGTGGTGATCTATATTTGTGAGATTGACCTCGATTTGTTGAAGGATAGCCCACCCTGGTGAACAACTTGTGAAAGAAGGTGTTTTACCCAAAAAAAGGTACTAAGAATGGCTGCTCAATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998450
ATGGCTGCTCAATCCAAAAAGAAAAAGAATCAGAAAGGTTATGCTGAGGAAACAGGTGATTCCCCTGTCAAAAAGAAGCAAAAGAGAATTTCACTTCCTGGTATAGTTATTCGAGAACCGATTTCTGGCCAAGTGAAGGGACCACTTACAATTCAACAAGATAAAAATAAGGGAAAAGGAAAAATAATTTTAGATCCCGACTCTGCCAAAGTAAAGAAATCGCGTACAGTGCAACAATATAAAAACAAGAATCCAGATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779848.1
MAAQSKKKKNQKGYAEETGDSPVKKKQKRISLPGIVIREPISGQVKGPLTIQQDKNKGKGKIILDPDSAKVKKSRTVQQYKNKNPDQMIEGECSKAAERKKNKGKRMLSEGKFCVKYYIVMRCLLKSRHLFYIYNHDICSCLCQNSEDKNEERESSDDDDFEVVHPRVQIANLMDVRCKRRGVKENFPKKKKVRQIMASVPGLRTRTSPASLFKKISLMNEAQKQAVRDMGFGSVLQLGVRKLPGKLAFWVVEHFDCKRC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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