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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003575`

染色体: Chr08 坐标: 38481790-38482746 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003575`
名称	SmilChr08G003575
描述	uncharacterized SmilChr08G003575
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	38481790 - 38482746 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998451`
GeneID	`130998451`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998451`
原始查询	`SmilChr08G003575`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os06g0523701` - identity=41.7; qcov=0.264; evalue=4.88e-16; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998451

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779850.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057779850.1`
3	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057779850.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779850.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779850.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:38481821`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	35	A23,A5,A6,A7,B106,B107,B133,B140,B15,B17,B20,B25,B46,B53,B55,B71,B72,B75,B76,B77,B8,B94,C10,C18,C24,C3,C60,C72,C77,C8,C81,C82,D1,D6,D9
`Chr8:38481822`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	36	A16,A20,A3,A9,B100,B118,B12,B121,B122,B127,B128,B13,B137,B140,B16,B25,B36,B4,B45,B48,B58,B80,B83,B86,B87,B9,B90,B98,C1,C20,C38,C72,C78,D10,D11,D8
`Chr8:38481833`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B13
`Chr8:38481862`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr8:38481884`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B140,C63
`Chr8:38481912`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,B88,C18,C54
`Chr8:38481929`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B20,B49
`Chr8:38481941`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,C75
`Chr8:38481962`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,B131,B134,B52,B61
`Chr8:38481965`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	78	A1,A10,A16,A23,A4,A7,A9,B101,B106,B107,B109,B114,B119,B134,B135,B136,B23,B25,B28,B32,B35,B38,B39,B4,B40,B42,B5,B53,B56,B57,B59,B66,B67,B7,B70,B75,B78,B85,B86,B9,B91,B93,B97,C11,C13,C19,C2,C24,C25,C26,C27,C3,C31,C34,C35,C36,C4,C40,C41,C42,C45,C46,C47,C49,C54,C55,C6,C61,C7,C71,C75,C77,C79,C80,C84,C85,D5,D8
`Chr8:38481989`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr8:38481999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C45,C62,C85

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923867.1
ATGTACAACACCATTCATATTGATGAAAAATGGTTTTACCTTACTAAAACCAAAGATAGGTATTACCTCATGCCGGATGAAGAGGAACCGTATAGAACATGTAAATCAAAGAGGTTCATTGACAAGATTATGTTCATGTGTGCTGTAGCACGTCCTATTATTGACATAGATGGCACAATTTTATTTGATGGAAAGTTGGGAATCTATCCCTTCACAACAACAGAACCAGCCAAGAGAAATTCAAAAAACAGATTGAAAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998451
ATGTACAACACCATTCATATTGATGAAAAATGGTTTTACCTTACTAAAACCAAAGATAGGTATTACCTCATGCCGGATGAAGAGGAACCGTATAGAACATGTAAATCAAAGAGGTTCATTGACAAGATTATGTTCATGTGTGCTGTAGCACGTCCTATTATTGACATAGATGGCACAATTTTATTTGATGGAAAGTTGGGAATCTATCCCTTCACAACAACAGAACCAGCCAAGAGAAATTCAAAAAACAGATTGAAAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779850.1
MYNTIHIDEKWFYLTKTKDRYYLMPDEEEPYRTCKSKRFIDKIMFMCAVARPIIDIDGTILFDGKLGIYPFTTTEPAKRNSKNRLKGTMEVKPIAAITKEVIKASLIQEMVPYFKAKWPQTANKNIFIQQDNAKPHIKPDDPDFLAVANTDGFKFQLVCQPANSPDTNKPARDVEELLKNVKDAYDEYPPEKLNNVFLTLQSCYHEIIKAKGGNNYKISHMNKDRLTRQGMLPDCIQVAEGLVRESLDFLQLECEIHNLG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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