当前解析结果
SmilChr08G003581| 统一新 Gene ID | SmilChr08G003581 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G003581 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G003581 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 38588328 - 38597372 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130996689 |
|---|---|
| GeneID | 130996689 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130996689 |
| 原始查询 | SmilChr08G003581 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130996689 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.80000 | XP_057777970.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057777970.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057777970.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057777970.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057777970.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:38588740 |
GAT |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 6 | A16,A19,A4,B123,C11,C38 |
Chr8:38588744 |
A |
ATC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 9 | B31,B34,B51,B72,B86,C29,C36,C51,C69 |
Chr8:38588766 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B130,B21,B44,B70,C87 |
Chr8:38588771 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B131 |
Chr8:38588774 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B40,C8,D11 |
Chr8:38588797 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B2 |
Chr8:38589800 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | A9,B113,D5 |
Chr8:38589800 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A9,B113,D5 |
Chr8:38589802 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B139,B36,C75 |
Chr8:38589842 |
G |
GT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 4 | B110,B27,C21,C82 |
Chr8:38589842 |
G |
GT |
1bp_insertion | CDS_variant | 4 | B110,B27,C21,C82 |
Chr8:38589876 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 196 | A1,A10,A11,A13,A16,A2,A24,A3,A4,A5,A7,A8,A9,B1,B10,B101,B102,B103,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B111,B113,B114,B115,B117,B118,B12,B121,B123,B124,B126,B127,B128,B131,B132,B134,B135,B136,B138,B139,B140,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B27,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B42,B43,B47,B48,B49,B5,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B68,B7,B71,B72,B73,B74,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B98,B99,C1,C10,C11,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C28,C29,C3,C30,C31,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C63,C64,C65,C66,C67,C69,C70,C71,C74,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C87,C9,D11,D3,D4,D5,D6,D7,D8,D9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
18 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。