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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003592`

染色体: Chr08 坐标: 38790161-38794574 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003592`
名称	SmilChr08G003592
描述	small RNA-binding protein 11, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	38790161 - 38794574 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996695`
GeneID	`130996695`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996695`
原始查询	`SmilChr08G003592`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	small RNA-binding protein 11, chloroplastic
产物	small RNA-binding protein 11%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G06210` (AT5G06210) RNA binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830508] identity=58.2; qcov=0.953; evalue=8.4e-52; confidence=high
Rice	`Os04g0414300` - identity=50; qcov=0.946; evalue=7.73e-41; confidence=medium
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996695

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057777975.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057777975.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777975.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777975.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777975.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:38792018`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:38792097`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B63,B8,C51,C57
`Chr8:38793835`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B129,B29
`Chr8:38793835`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B129,B29
`Chr8:38793860`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr8:38794255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,C14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777975.1

148 aa

148

RRM_1

PF00076 RRM_1 50-119 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777975.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	50	119	1e-23	83.7	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921992.1
TTATAAAAAACTAGGGCTGGTCGGACTCAAACAATTTTCAACTTTCACGCCTCCTTCTCCAGGCCCTCCACGCCCTTCAGCCACTTCCCGTCGGCCTCTGCACCCTCCGGCGACCGGAGCCTCATCCCACCGCGCCCATCTCCCACAGCGCCACCGCGCCCTCCTCTGCCTTCGGCCCCTTGGCCCTTCCCGTTTGCCTCTGCACTCTCCGGCGATCAGAGCATCGTCCAACCGCACCCATCTCCCTCTGCACCCACCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996695
ATGAAGCCATCGACCATGGCGGCCATGAGGAAACTGTCAAATAACATCATCTTTTCCTCTCACCTTACAAAATCCAGTTCAAATATTGTCTCGCCATCTTCAGTAATTCCAGCCCTCTTAGTTTTTAACAGAGGCATAGCATCCAAGCTCTTCGTCGGAGGCCTTTCATTCTACACAACCGAACAGGGATTGTCTGAGGCATTTTCTCAACACGGTCAAGTTATCGAAGCTAAAATTGTGATGGACAGAGTATCAGATCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777975.1
MKPSTMAAMRKLSNNIIFSSHLTKSSSNIVSPSSVIPALLVFNRGIASKLFVGGLSFYTTEQGLSEAFSQHGQVIEAKIVMDRVSDRSKGFGFVTYASEDEAEKAIAEMDGKELNGRVVFVDYAKPRSRGSRDSMPIARGPPEPAPQS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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