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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003598`

染色体: Chr08 坐标: 38989666-38993663 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003598`
名称	SmilChr08G003598
描述	uncharacterized SmilChr08G003598
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	38989666 - 38993663 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996701`
GeneID	`130996701`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996701`
原始查询	`SmilChr08G003598`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hydroxyproline-rich glycoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817820]; symbol=AT2G32600; hit=AT2G32600; species=arabidopsis; confidence=high
产物	hydroxyproline-rich glycoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817820]; symbol=AT2G32600; hit=AT2G32600; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G32600` (AT2G32600) hydroxyproline-rich glycoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817820] identity=87.3; qcov=0.675; evalue=1.46e-140; confidence=high
Rice	`Os03g0263500` - identity=81.7; qcov=0.678; evalue=3.68e-128; confidence=high
GO	GO:0000245 (spliceosomal complex assembly); GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005686 (U2 snRNP); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0071004 (U2-type prespliceosome); GO:0071013 (catalytic step 2 spliceosome)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF12874 (zf-met); PF16835 (SF3A2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996701

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777988.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057777988.1`
3	Nuclear speckle	核斑点	0.40000	`XP_057777988.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057777988.1`
5	Chromatin	染色质	0.20000	`XP_057777988.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:38989759`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B77,C19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777988.1

338 aa

169

338

zf-met

SF3A2

PF12874 zf-met 52-76 aa PF16835 SF3A2 110-204 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777988.1`	Pfam	`PF12874`	zf-met	Domain	52	76	7.3e-07	30.0	Zinc-finger of C2H2 type
`XP_057777988.1`	Pfam	`PF16835`	SF3A2	Domain	110	204	1.5e-37	128.4	Pre-mRNA-splicing factor SF3a complex subunit 2 (Prp11)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922005.1
TTTATAAACGTTATACCCCTCATCATCTCTCTCTCATCCTCCTTTCTACGCAGATTTACACAGCAATGGACAGGGAGTGGGGTTCGAAGCCGGGAAGCGGAGGCGCCGCCACCGCCCAGAATGAGGCCATCGACCGACGGGAGCGGCTCCGCCGACTTGCCCTCGAAACCATTGATTTGGCCAAAGATCCCTATTTCATGCGCAACCACCTCGGAAGTTACGAGTGTAAACTCTGCTTGACCTTGCACAACAATGAGGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996701
ATGGACAGGGAGTGGGGTTCGAAGCCGGGAAGCGGAGGCGCCGCCACCGCCCAGAATGAGGCCATCGACCGACGGGAGCGGCTCCGCCGACTTGCCCTCGAAACCATTGATTTGGCCAAAGATCCCTATTTCATGCGCAACCACCTCGGAAGTTACGAGTGTAAACTCTGCTTGACCTTGCACAACAATGAGGGAAATTACTTGGCGCACACACAGGGGAAGCGTCACCAGACCAACTTGGCTAAGCGAGCGGCTCGTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777988.1
MDREWGSKPGSGGAATAQNEAIDRRERLRRLALETIDLAKDPYFMRNHLGSYECKLCLTLHNNEGNYLAHTQGKRHQTNLAKRAAREAKEAPAQPQPHKRKVTLKKIVKIGRPGYRVTKQFDPETKQRSLLFQIEYPEIEDNTKPRHRFMSSFEQKVQPFDKRYQYLLFAAEPYEIISFKVPSTEIDKSTPKFFSHWDPDSKMFTLQLYFKTKPPETNKPQPAPAANGTAAPGAPPRSLPPPPPPQGPPPAPPTGNPPRP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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