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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003601`

染色体: Chr08 坐标: 39053241-39057112 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003601`
名称	SmilChr08G003601
描述	B3 domain-containing protein At2g36080-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	39053241 - 39057112 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996704`
GeneID	`130996704`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996704`
原始查询	`SmilChr08G003601`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	B3 domain-containing protein At2g36080-like
产物	B3 domain-containing protein At2g36080-like
Arabidopsis	`AT2G36080` (ABS2) AP2/B3-like transcriptional factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818181] identity=54.5; qcov=0.721; evalue=5.28e-70; confidence=high
Rice	`Os11g0156000` - identity=49.4; qcov=0.739; evalue=2.9e-57; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity)
KEGG	-
Pfam	PF02362 (B3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996704

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777992.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777992.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777992.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777992.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057777992.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:39056183`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr8:39056194`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B2,B46,B97
`Chr8:39056194`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B2,B46,B97
`Chr8:39056207`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	74	A21,A25,A3,A4,A6,A7,A8,B105,B107,B108,B109,B113,B114,B115,B123,B128,B137,B140,B15,B16,B18,B20,B24,B25,B26,B3,B33,B34,B35,B41,B45,B5,B55,B56,B76,B77,B82,B84,B86,B89,B95,B96,B99,C1,C15,C18,C19,C20,C23,C25,C3,C30,C34,C4,C44,C49,C5,C50,C54,C56,C58,C63,C65,C67,C70,C71,C73,C77,C82,C86,C87,D1,D10,D11
`Chr8:39056558`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	80	A13,A14,A22,A4,A5,A8,B104,B108,B109,B111,B117,B118,B120,B122,B123,B125,B130,B139,B14,B140,B15,B16,B21,B23,B25,B26,B33,B36,B38,B39,B4,B41,B47,B52,B54,B56,B59,B63,B68,B70,B71,B8,B80,B83,B84,B89,B91,B95,B96,C10,C16,C17,C18,C20,C23,C28,C3,C39,C4,C43,C51,C56,C57,C58,C59,C65,C70,C71,C72,C75,C77,C81,C84,C87,C9,D11,D2,D4,D6,D9
`Chr8:39056560`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	80	A13,A14,A22,A4,A5,A8,B104,B108,B109,B111,B117,B118,B120,B122,B123,B125,B130,B139,B14,B140,B15,B16,B21,B23,B25,B26,B33,B36,B38,B39,B4,B41,B47,B52,B54,B56,B59,B63,B68,B70,B71,B8,B80,B83,B84,B89,B91,B95,B96,C10,C16,C17,C18,C20,C23,C28,C3,C39,C4,C43,C51,C56,C57,C58,C59,C65,C70,C71,C72,C75,C77,C81,C84,C87,C9,D11,D2,D4,D6,D9
`Chr8:39056572`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	25	A13,A8,B104,B109,B118,B125,B15,B26,B38,B39,B63,B8,B84,B95,C17,C20,C23,C3,C51,C57,C71,C77,C81,D11,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777992.1

326 aa

163

326

PF02362 B3 94-198 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777992.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	94	198	5e-28	97.7	B3 DNA binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922009.1
CGTGTTGCCTTGAAAAGTTACACAGTGGATTGCACTGATTATAATGATTGATTTTCCCAGTCACTCACGCAACTACAACAACCTTAAACAACTACACCCCACCGCCCCCTCCCAACAGATATATACGTACATGCATCTCGTATTTATACACATCTCTCTCTTGAATATTGCAGCTACCGCATTTTTCCACATCGAAACAAAACAATATATACGACGCTTGTGTGTGAGAGAGAAACGAGGCGCCCCACTCTACCTTCCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996704
ATGTCAATAAACCACTTCTCTACAGAGCTTCCAGAAGCCCACTGGTGGTCACACTATACAATGGATCATTCAGCACCTGCCAAAACCTCATCCCCTTACCAGAAACCCTGCATCTCTACCACCGCTAATTCGCACAATTCCGCCGCCGCATTCTACCGCGCCGCGCCAATGTTCTGCAGCCCCGCCCCCGCCTTCGACCTCAACAATGAAGACGACGAGGAGTCGGCGGACGAGCACGCCTCGTCCACATCGGACCACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777992.1
MSINHFSTELPEAHWWSHYTMDHSAPAKTSSPYQKPCISTTANSHNSAAAFYRAAPMFCSPAPAFDLNNEDDEESADEHASSTSDHEIPKDRLFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQHAEKHFPLNASGESGENGLLLGFEDELGKSWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDIVVFARHRVDAGRLFIGWRRRTXVAGLDAAAAQPVASGSGGAWSRVIYPGHPYQIQQQPPSNSLHFQSEGVHAGYHQKQTSSA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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