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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003602`

染色体: Chr08 坐标: 39080976-39083688 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003602`
名称	SmilChr08G003602
描述	uncharacterized SmilChr08G003602
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	39080976 - 39083688 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998459`
GeneID	`130998459`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998459`
原始查询	`SmilChr08G003602`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=32; qcov=0.228; evalue=5.88e-19; confidence=weak
Rice	`Os06g0484800` - identity=28; qcov=0.854; evalue=1.25e-58; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998459

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779860.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057779860.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057779860.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779860.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779860.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:39080994`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr8:39081017`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr8:39081019`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,B88
`Chr8:39081034`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A6,B1,B88,C39,C52,C57,C87
`Chr8:39081053`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A6,B88,C39
`Chr8:39081053`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B88,C39
`Chr8:39081263`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	65	A10,A18,A2,A22,A4,A5,A6,B1,B101,B108,B110,B111,B117,B124,B135,B136,B17,B21,B24,B25,B26,B33,B35,B38,B39,B54,B58,B59,B62,B63,B66,B68,B70,B76,B8,B81,B82,B88,B89,B97,B99,C1,C12,C18,C23,C27,C3,C32,C35,C39,C48,C51,C52,C55,C57,C58,C64,C66,C68,C74,C76,C84,C87,D5,D8
`Chr8:39081274`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B60,B63,B76,B8,C51,C57
`Chr8:39081298`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr8:39081312`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B33,C75,C9
`Chr8:39081316`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B33,C75,C9
`Chr8:39081324`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B131

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779860.1

753 aa

376

753

RVT_1

PF00078 RVT_1 251-502 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779860.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	251	502	8.3e-28	98.3	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923877.1
ATGTGGTACTCTACTACTTCGATGGTTCTTCCTAGGCTTGGATCCGATCATTCCCCTATTCTGTTGAGATGCCAGGACACGGCTACTCCTCCCAAGGGACGTCGATTTCGTTTCCTGAATATGTGGTGTTCGCATGAGGGGTTTCTGGATCAGGTTCGTGCTTCTTGGTCACAGCCGATGGATTGTCTCTGCCCGATGGTTCGGGTTATGAAAAAGTTGAAGCGTCTTTGCCCGACTCTCAAAACTTGGAATAAAGACAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998459
ATGTGGTACTCTACTACTTCGATGGTTCTTCCTAGGCTTGGATCCGATCATTCCCCTATTCTGTTGAGATGCCAGGACACGGCTACTCCTCCCAAGGGACGTCGATTTCGTTTCCTGAATATGTGGTGTTCGCATGAGGGGTTTCTGGATCAGGTTCGTGCTTCTTGGTCACAGCCGATGGATTGTCTCTGCCCGATGGTTCGGGTTATGAAAAAGTTGAAGCGTCTTTGCCCGACTCTCAAAACTTGGAATAAAGACAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779860.1
MWYSTTSMVLPRLGSDHSPILLRCQDTATPPKGRRFRFLNMWCSHEGFLDQVRASWSQPMDCLCPMVRVMKKLKRLCPTLKTWNKDTFGNYNVTLAELQQDLSSLRENIDEQGYTDDLFDQEVNLQARIGSVLLRKSEHLRQQSRVSWLSDGDRNTRFFHSMVKWRRSNQNNKQLNIDGVISEDQTVMAAHVIHFYEDLFSEPNSEPVDRSWISGYIPASVSSAQATMLTAPPSDEDIRLAVFSMDRNSAPDFRPIVLGN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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