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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003605`

染色体: Chr08 坐标: 39120458-39124058 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003605`
名称	SmilChr08G003605
描述	uncharacterized protein At5g41620-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	39120458 - 39124058 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996707`
GeneID	`130996707`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996707`
原始查询	`SmilChr08G003605`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	golgin family A protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820332]; symbol=AT3G11590; hit=AT3G11590; species=arabidopsis; confidence=high
产物	golgin family A protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820332]; symbol=AT3G11590; hit=AT3G11590; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G11590` (AT3G11590) golgin family A protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820332] identity=47.3; qcov=1.05; evalue=3.25e-137; confidence=high
Rice	`Os04g0382800` - identity=40.3; qcov=0.516; evalue=2.57e-51; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996707

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	1.00000	`XP_057777997.1`
2	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057777997.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057777998.1`
4	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057777997.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777997.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:39121305`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B91,C33,C61
`Chr8:39121498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr8:39121593`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B52,B61,C21
`Chr8:39121608`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr8:39121820`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B46,B97
`Chr8:39121887`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B58
`Chr8:39122087`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr8:39122147`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A15
`Chr8:39122147`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A15
`Chr8:39123004`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr8:39123210`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B28,B50,C50
`Chr8:39123219`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B28,B50,C50,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009092748.1
GTCTATTCAGAGTGTCCGACTAGACAAAGAATTTTGAGCAGCCGTCATCAATCATACCAAATTAAACTAAATATTTTAACCAATTTTAATTCTTCAGACACGCCAGATTTGCACCTAGTTAAAGACATTCTTGTACACCCCCCCACTTACTACCCACCATGCTCTCTCCCGCTTTGTCCGCGTGTACCACGCGCTCCATCTCCAGTACCTCAGCTTTCAATCCATAATCAAAGTCAAGCAAGCTGCACTCTTTTTCACGA...

XR_009092749.1
GTCTATTCAGAGTGTCCGACTAGACAAAGAATTTTGAGCAGCCGTCATCAATCATACCAAATTAAACTAAATATTTTAACCAATTTTAATTCTTCAGACACGCCAGATTTGCACCTAGTTAAAGACATTCTTGTACACCCCCCCACTTACTACCCACCATGCTCTCTCCCGCTTTGTCCGCGTGTACCACGCGCTCCATCTCCAGTACCTCAGCTTTCAATCCATAATCAAAGTCAAGCAAGCTGCACTCTTTTTCACGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130996707
ATGACGAGGAGAGGGCATAGGGAAGTGATGATGGAGGGATTGAATTTGAATGAGCCCACCAAGATTCGGAAAAGGGGATGCTCATCTTCGCCATCTTCATCATCAAGAATTTACAATTATAGGCTGAGCAAACGGGCCATATTGGTAGGGAAGAACCGTGGGGTCGGGCTGGGGCGGTCCCGATCCAGCACCCCCGTGCCGACGTGGAGAACCACCCCTTTGAGGGGCGCCATTGAGACTCCCAAGTACTCGCAGGGCGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057777997.1
MTRRGHREVMMEGLNLNEPTKIRKRGCSSSPSSSSRIYNYRLSKRAILVGKNRGVGLGRSRSSTPVPTWRTTPLRGAIETPKYSQGGRSARPVSARRLAATLWEMNEMPSPKMSESNLDVRKRQQRKSGSRMSLKAEKLMHSGFGLHSGSGSGYLPPHLSDPPHSPTVSEKMDRSGTGSRRRPSISQKLMSADRNSGPIDSVSNASFMEIETRSRPQISSESGVGGKNRLKEASSALTTSKELLKIINRLWAQADQPSSS...

XP_057777998.1
MTRRGHREVMMEGLNLNEPTKIRKRGCSSSPSSSSRIYNYRLSKRAILVGKNRGVGLGRSRSSTPVPTWRTTPLRGAIETPKYSQGGRSARPVSARRLAATLWEMNEMPSPKMSESNLDVRKRQQRKSGSRMSLKAEKLMHSGFGLHSGSGSGYLPPHLSDPPHSPTVSEIETRSRPQISSESGVGGKNRLKEASSALTTSKELLKIINRLWAQADQPSSSMSLISALHSELERARLQVNQLIQEQRSEKNDINYLIKCF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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