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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003607`

染色体: Chr08 坐标: 39157618-39159886 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003607`
名称	SmilChr08G003607
描述	IAA-amino acid hydrolase ILR1-like 3
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	39157618 - 39159886 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996711`
GeneID	`130996711`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996711`
原始查询	`SmilChr08G003607`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	IAA-amino acid hydrolase ILR1-like 3
产物	IAA-amino acid hydrolase ILR1-like 3
Arabidopsis	`AT3G02875` (ILR1) Peptidase M20/M25/M40 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821199] identity=57.5; qcov=0.918; evalue=1.17e-171; confidence=high
Rice	`Os07g0249700` (OsILR1) - identity=62.2; qcov=0.911; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0009850 (auxin metabolic process); GO:0010179 (IAA-Ala conjugate hydrolase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01546 (Peptidase_M20); PF07687 (M20_dimer)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996711

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057778002.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057778002.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057778002.1`
4	Endoplasmic reticulum lumen	内质网腔	0.20000	`XP_057778002.1`
5	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057778002.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:39157853`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr8:39158057`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr8:39158983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr8:39159056`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr8:39159447`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:39159551`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr8:39159669`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B117,B94,C30,C38
`Chr8:39159669`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B117,B94,C30,C38
`Chr8:39159675`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	58	A14,A2,A23,A5,B112,B119,B12,B126,B129,B132,B138,B23,B28,B29,B3,B31,B32,B40,B42,B43,B5,B53,B57,B63,B66,B7,B78,B8,B80,B81,B9,B91,B93,B99,C19,C26,C27,C3,C32,C35,C36,C37,C42,C45,C46,C47,C61,C62,C64,C66,C68,C7,C77,C84,C85,C86,D5,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778002.1

438 aa

219

438

Peptidase_M20

M20_dimer

PF01546 Peptidase_M20 113-428 aa PF07687 M20_dimer 222-321 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778002.1`	Pfam	`PF01546`	Peptidase_M20	Family	113	428	7.3e-43	147.6	Peptidase family M20/M25/M40
`XP_057778002.1`	Pfam	`PF07687`	M20_dimer	Domain	222	321	2.4e-13	50.7	Peptidase dimerisation domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922019.1
AAGCGCATAGTTAAACTACTTCTTGTTCTTGTTACGCGATGGGATCCTAAATAATCCGGGAATTGCAGTCCAAATCAAAGTATTTAGCTGACGTTTTATGAATATAAATTATTCAAATAGAGGAAGAAAAAAGGAGAAAAATAAAATAATAGAGCATATAGCACGCATGGGGCGAGGAGAGAGAAATGTCAAATGCGAAGCTGTTTTTTAATTCCGAAATGAGGCGGTTGATTTCCTTGGCTCTCCTAGCCCTTGTCTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996711
ATGTCAAATGCGAAGCTGTTTTTTAATTCCGAAATGAGGCGGTTGATTTCCTTGGCTCTCCTAGCCCTTGTCTCGGTCTGTTGTGATGGAGTTTGGGGTCTGCAGACTGAGTCGCTAACTCGGGAGCTCTTGGAATCGACGAGGGATGCGGAGTTCTTCGGCTGGTTGAAAACGGTTCGGAGGAGAATCCACGAGTATCCGGAACTTGCATTTCAAGAGAAACGAACGAGTCAACTCATTCGAGCTGAGCTCGACTCGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778002.1
MSNAKLFFNSEMRRLISLALLALVSVCCDGVWGLQTESLTRELLESTRDAEFFGWLKTVRRRIHEYPELAFQEKRTSQLIRAELDSLGIQYEWPVAETGVVATIGSGSGPCFALRADMDALPIQELVEWEHKSKIDGKMHACGHDAHVTMLLGAAKLLHKNRHKLKGTIKLVFQPAEEGHAGAYHMIKQGALDGVEAIFGLHVDPTLPTGTVSSKPGPMLAGAGRFKVDVQGKGGHAASPHKTTDPVLALAMVVLALQHI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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