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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003620`

染色体: Chr08 坐标: 39372884-39374161 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003620`
名称	SmilChr08G003620
描述	short chain aldehyde dehydrogenase 1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	39372884 - 39374161 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996721`
GeneID	`130996721`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996721`
原始查询	`SmilChr08G003620`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	short chain aldehyde dehydrogenase 1-like
产物	short chain aldehyde dehydrogenase 1-like
Arabidopsis	`AT1G52340` (ABA2) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841665] identity=48.7; qcov=0.985; evalue=7.96e-79; confidence=high
Rice	`Os04g0179200` (OsMAS) - identity=55.6; qcov=0.948; evalue=3.91e-82; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00106 (adh_short); PF08659 (KR); PF13561 (adh_short_C2); PF23441 (SDR)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996721

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057778006.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057778006.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.60000	`XP_057778006.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778006.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778006.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:39373242`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr8:39373348`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr8:39373359`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr8:39373368`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr8:39373511`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr8:39373553`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C87
`Chr8:39373588`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr8:39373676`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr8:39373794`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr8:39373926`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778006.1

271 aa

136

271

SDR

adh_short

adh_short_C2

PF23441 SDR 3-254 aa PF00106 adh_short 8-195 aa PF08659 KR 11-168 aa PF13561 adh_short_C2 16-254 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778006.1`	Pfam	`PF23441`	SDR	Domain	3	254	5.3e-10	39.8	SDR-like rossmann domain
`XP_057778006.1`	Pfam	`PF00106`	adh_short	Domain	8	195	5.5e-46	157.2	short chain dehydrogenase
`XP_057778006.1`	Pfam	`PF08659`	KR	Family	11	168	1.7e-06	28.8	KR domain
`XP_057778006.1`	Pfam	`PF13561`	adh_short_C2	Domain	16	254	8.6e-60	203.0	Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922023.1
TTTGTCATTTTTCTTTTTCTTAAAAAAAAATAAATAAATAAACTGATGAGATTAGATCTAGCAGTCTACACACTTAAGTCTGTACATATATTTTATCCAAACATCGATTTCAACCATAAACCGAGCTTACTATCTTGCTGTATCAATGGCGAAAAGGTTGGAAGGCAAGGTAGCGATCATCACCGGGGGCGCCAGCGGCATCGGCGAGTGCGCCGCGTGGCTCTTTGTTCGGCATGGCGCCAAAGTCGTCGTGGCGGATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996721
ATGGCGAAAAGGTTGGAAGGCAAGGTAGCGATCATCACCGGGGGCGCCAGCGGCATCGGCGAGTGCGCCGCGTGGCTCTTTGTTCGGCATGGCGCCAAAGTCGTCGTGGCGGATGTGCAGGACGACCTCGGGAGGGCTCTGTGCCGGAGCATCGGGTCCCCCGAGGTCATCTCATACGTCCACTGCGACGTGGCGAGCGAGGCCGACGTCGCGGGCGCGGTCGACTTCGCCGTCTCCGAGTACGGAAGGCTCGACATAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778006.1
MAKRLEGKVAIITGGASGIGECAAWLFVRHGAKVVVADVQDDLGRALCRSIGSPEVISYVHCDVASEADVAGAVDFAVSEYGRLDIMFSNAAVPGKGKAGILAADYEDVKRVFDVNVFGAFMCAKHAARVMIPAARGSIVFTSSVASVTHGDVPHAYVVSKHALVGLMKNLCIEMGAHGIRVNCVSPFGVPTPMLIGALRMTKKAEAEELVSEIANLKGAVVGVDDVAEAALFLASDEAKYISGQNIVIDGGYSLTNIAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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