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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003628`

染色体: Chr08 坐标: 39541458-39542245 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003628`
名称	SmilChr08G003628
描述	40S ribosomal protein S17-2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	39541458 - 39542245 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996727`
GeneID	`130996727`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996727`
原始查询	`SmilChr08G003628`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	40S ribosomal protein S17-2-like
产物	40S ribosomal protein S17-2-like
Arabidopsis	`AT2G05220` (AT2G05220) Ribosomal S17 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815070] identity=76.4; qcov=1; evalue=4.23e-73; confidence=high
Rice	`Os03g0109500` (OsRPS17) - identity=73.9; qcov=0.986; evalue=7.46e-69; confidence=high
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00833 (Ribosomal_S17e)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996727

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057778007.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057778007.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778007.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778007.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778007.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:39541652`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr8:39541774`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr8:39541842`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B139,B140,B32,B72,C4,C82,D4
`Chr8:39541855`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B49,C32,C68
`Chr8:39541884`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr8:39541928`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:39541971`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C43
`Chr8:39541971`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C43
`Chr8:39542041`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B139,B140,B72,C4,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778007.1

144 aa

144

Ribosomal_S17e

PF00833 Ribosomal_S17e 1-118 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778007.1`	Pfam	`PF00833`	Ribosomal_S17e	Family	1	118	7.8e-59	197.7	Ribosomal S17

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922024.1
TAAAAAACTATGGCCCAAGTTCAAGATGTCGAGGCTGAGGCCCAATCTCAAATTAGTTTTCAAGTTTATACGACAGATAATCTCTCTCAAATTATAAAATCCCCAAAAGCTTCTATTGACTGTCCCCCAAAACCCTAGCAAAATCTCCGCCGCTCCGCCGCCGCAATGGGTCGCGTCCGCACGAAGACAGTGAAGAAGTCCTCCCGGCAGGTGATTGAGGGACACTACCCGAAGATGACCCTTGACTTCCACACCAACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996727
ATGGGTCGCGTCCGCACGAAGACAGTGAAGAAGTCCTCCCGGCAGGTGATTGAGGGACACTACCCGAAGATGACCCTTGACTTCCACACCAACAAGAAGGTTCTAGAAGAGGTAGCCATAATCCCGTCGAAACGCCTCCGCAACAAGATCGCCGGTTTCTCGACCCATCTGATGAAACGGATCCAGAAAGGACCCGTCCGCGGTATCTCGCTGAAGCTGCAGGAGGAGGAGCGGGAACGCCGAATGGACTACGTGCCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778007.1
MGRVRTKTVKKSSRQVIEGHYPKMTLDFHTNKKVLEEVAIIPSKRLRNKIAGFSTHLMKRIQKGPVRGISLKLQEEERERRMDYVPDESAIKVDRIEVDQDTVDMLESLGMKDLPGIEIRVDQHQGAIAVAPQINYGRSAARRY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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