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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003629`

染色体: Chr08 坐标: 39550274-39551402 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003629`
名称	SmilChr08G003629
描述	uncharacterized SmilChr08G003629
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	39550274 - 39551402 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998464`
GeneID	`130998464`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998464`
原始查询	`SmilChr08G003629`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013]; symbol=AT3G24255; hit=AT3G24255; species=arabidopsis; confidence=low
产物	RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013]; symbol=AT3G24255; hit=AT3G24255; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=27.8; qcov=0.854; evalue=1.3e-13; confidence=low
Rice	`Os11g0672600` - identity=22.4; qcov=0.857; evalue=4.89e-11; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998464

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779867.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057779867.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057779867.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779867.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779867.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:39550349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr8:39550371`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:39550373`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	B17,B19,B53,B68,B91,B94,C10,C14,C79
`Chr8:39550603`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B137,C24
`Chr8:39550632`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr8:39550635`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr8:39550673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,C61
`Chr8:39550742`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:39550767`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:39550977`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:39551029`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr8:39551036`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B100,B101

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923884.1
ATGTCGAGTAGGGATTTATTTTCTTCGCATCTCCTTTATGCGGATGATGTGCTCCTTTTCTGTAGGGCCACTGCGCGTAACAGCATCGCGATTGACTCTATTTTGGATATCTATGGTAGTGTCTCTGGTAAAGCTTTCGCGACGTGCCTTATGGGTATTAAGGATCACATTATGGGGAATTTTACTCGTTGGAAAGGTCATCATCTCTCGATGGCTGGGCGTATGTGCTTGGTCTCCTCTGTGGTTCACAGTGCTGCCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998464
ATGTCGAGTAGGGATTTATTTTCTTCGCATCTCCTTTATGCGGATGATGTGCTCCTTTTCTGTAGGGCCACTGCGCGTAACAGCATCGCGATTGACTCTATTTTGGATATCTATGGTAGTGTCTCTGGTAAAGCTTTCGCGACGTGCCTTATGGGTATTAAGGATCACATTATGGGGAATTTTACTCGTTGGAAAGGTCATCATCTCTCGATGGCTGGGCGTATGTGCTTGGTCTCCTCTGTGGTTCACAGTGCTGCCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779867.1
MSSRDLFSSHLLYADDVLLFCRATARNSIAIDSILDIYGSVSGKAFATCLMGIKDHIMGNFTRWKGHHLSMAGRMCLVSSVVHSAATHSMLVYRWPTRQLNELDKACRNFIWTGDARRSHSSVSWTKVCKPKFAGLHPRSRWASSTVWKGVRSTIETLRDDSFCSMGNVSSVLYWLDNWMGYKIMDHLKFPAYIHPYLMHTVVDYLVEGVWHLTMGFTEPYPEIAYDIITTPISQSIDSRAWVHNDFGLVTATSARRHLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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