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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003645`

染色体: Chr08 坐标: 39921809-39922808 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003645`
名称	SmilChr08G003645
描述	uncharacterized SmilChr08G003645
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	39921809 - 39922808 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998468`
GeneID	`130998468`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998468`
原始查询	`SmilChr08G003645`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ADP-ribosylation factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816354]; symbol=TTN5; hit=AT2G18390; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	ADP-ribosylation factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816354]; symbol=TTN5; hit=AT2G18390; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G18390` (TTN5) ADP-ribosylation factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816354] identity=89.4; qcov=0.258; evalue=4.07e-25; confidence=weak
Rice	`Os02g0327100` (OsTTN5) - identity=83; qcov=0.258; evalue=1.13e-22; confidence=weak
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding)
KEGG	-
Pfam	PF00025 (Arf)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998468

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779870.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057779870.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057779870.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779870.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779870.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:39921831`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B63,B8,C51,C57
`Chr8:39921834`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr8:39922212`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,B131
`Chr8:39922221`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B121,B133,B76,C16
`Chr8:39922234`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B5,B51,B93,D8
`Chr8:39922255`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C61
`Chr8:39922258`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C61
`Chr8:39922275`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr8:39922291`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C48
`Chr8:39922291`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C48
`Chr8:39922295`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C48
`Chr8:39922295`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779870.1

182 aa

182

Arf

PF00025 Arf 132-174 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779870.1`	Pfam	`PF00025`	Arf	Domain	132	174	4.4e-06	27.0	ADP-ribosylation factor family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923887.1
ATGCGGGGCCCACCAAGAATGTTTACACGGGTTTCTCAAACAACCGATGCATACGAAGAGTCTCCCACACTCAAAACTCAAGAGCGGCAGAAGATATTGAAGACGACGAAGTTGGAAGCAGCGGGCGATTTCTCAGGCAATAAGATGGCAAATCCTATGATCACCTTTGTGTTCAATCTTTTTGGTATTTGGTCTAAAGATGAAAACAGTGGTGAAATCCAATATGAGGGTTATGATTCGTCAGAAATAGAAGACATCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998468
ATGCGGGGCCCACCAAGAATGTTTACACGGGTTTCTCAAACAACCGATGCATACGAAGAGTCTCCCACACTCAAAACTCAAGAGCGGCAGAAGATATTGAAGACGACGAAGTTGGAAGCAGCGGGCGATTTCTCAGGCAATAAGATGGCAAATCCTATGATCACCTTTGTGTTCAATCTTTTTGGTATTTGGTCTAAAGATGAAAACAGTGGTGAAATCCAATATGAGGGTTATGATTCGTCAGAAATAGAAGACATCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779870.1
MRGPPRMFTRVSQTTDAYEESPTLKTQERQKILKTTKLEAAGDFSGNKMANPMITFVFNLFGIWSKDENSGEIQYEGYDSSEIEDILGNMTFEQIMSEFESSEACLMSKPRAVYAYDEDYRLDKGLILIRDQRHCAKVLNLDAMDKSRHWKIVGCSAFTGEGLLEGFDWMVQDIASRIYMLD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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