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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003649`

染色体: Chr08 坐标: 40098601-40103368 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003649`
名称	SmilChr08G003649
描述	nuclear transcription factor Y subunit A-10-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	40098601 - 40103368 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996744`
GeneID	`130996744`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996744`
原始查询	`SmilChr08G003649`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclear transcription factor Y subunit A-10-like
产物	nuclear transcription factor Y subunit A-10-like
Arabidopsis	`AT5G06510` (NF-YA10) nuclear factor Y, subunit A10 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830539] identity=41.9; qcov=0.883; evalue=3.87e-36; confidence=medium
Rice	`Os12g0618600` (OsHAP2F) - identity=48; qcov=0.635; evalue=7.97e-32; confidence=medium
GO	GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II)
KEGG	-
Pfam	PF02045 (CBFB_NFYA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996744

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057778014.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057778014.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778014.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778014.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778014.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:40102575`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C59,D11
`Chr8:40102634`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B84,C3
`Chr8:40102682`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,C61
`Chr8:40102851`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778014.1

230 aa

115

230

CBFB_NFYA

PF02045 CBFB_NFYA 105-202 aa

XP_057778015.1

230 aa

115

230

CBFB_NFYA

PF02045 CBFB_NFYA 105-202 aa

XP_057778016.1

230 aa

115

230

CBFB_NFYA

PF02045 CBFB_NFYA 105-202 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778014.1`	Pfam	`PF02045`	CBFB_NFYA	Domain	105	202	1.9e-31	109.6	CCAAT-binding transcription factor (CBF-B/NF-YA) subunit B
`XP_057778015.1`	Pfam	`PF02045`	CBFB_NFYA	Domain	105	202	1.9e-31	109.6	CCAAT-binding transcription factor (CBF-B/NF-YA) subunit B
`XP_057778016.1`	Pfam	`PF02045`	CBFB_NFYA	Domain	105	202	1.9e-31	109.6	CCAAT-binding transcription factor (CBF-B/NF-YA) subunit B

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922033.1
ATAATAATCATATAAAGAAAAGTAAAGTTGATGAAAGATACCTATTATTTGCATTCGTGTGCATTTGTCACTATACATATATACTCCCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTGTTTGAATAGTACCGACAGTTGATTTGGTGGTTGTTTTCTTCTCTAGCTAGGCCACCTGCAAATTGGTGAAAAATGACCCTGCACACTGTATTCTTCAAAGATGGGAGTGCGAATGCGGCGGCGCAGTCA...

XM_057922032.1
CATCTCGATATTTAATTTAGTGAATACATGCTACAGCAACAACCATCATGATTCAAATTTCTGCAGCTCTGAATTTATGAGCTGTACATACAATACTAATAATTGCAGTAATGCAAAAACAGCTAATGTTTTTAAGTTTAACTATACTTTGTTTATATGTATCTATCTATATGTGTATGGAATTTTTAGGTAAAGAAAGCCGGCTATTTTTTATACACCTCCAACATCCAAAGAATTTGGATAAGGTGAAAAATGACCCT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130996744
ATGACCCTGCACACTGTATTCTTCAAAGATGGGAGTGCGAATGCGGCGGCGCAGTCAGCCGTGCCGCGGTGGAGCGGACTCGGATGTCAGCCGCCGGGCGTTTACGGCGAAGGGTTTATCCAATCAAAGGGCGCCGCCGCGTGCCTCGATGGTGTTAAAGATCATCATGGAAAGCCTCACTTCACTCTTTTCTCTGGTGACTGCAAAACTACTCATGAAAATGAAAAAACTCCGTTGCAGACAGCTTCCTCTGCCGCCGT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057778014.1
MTLHTVFFKDGSANAAAQSAVPRWSGLGCQPPGVYGEGFIQSKGAAACLDGVKDHHGKPHFTLFSGDCKTTHENEKTPLQTASSAAVDYLELGFGQPMICGAKYPYPDQCYGLYSSYNGPQFAGRMMLPLNGGPILVNAKQYNGIMRRRKKRAEAELENKLLKIRKPYLHLSRHLHAKRRPRGNGGRFLNTKGKEKMTTSSSSQGSDVSSDQELHFPRLHLFHHPFSFKV

XP_057778015.1
MTLHTVFFKDGSANAAAQSAVPRWSGLGCQPPGVYGEGFIQSKGAAACLDGVKDHHGKPHFTLFSGDCKTTHENEKTPLQTASSAAVDYLELGFGQPMICGAKYPYPDQCYGLYSSYNGPQFAGRMMLPLNGGPILVNAKQYNGIMRRRKKRAEAELENKLLKIRKPYLHLSRHLHAKRRPRGNGGRFLNTKGKEKMTTSSSSQGSDVSSDQELHFPRLHLFHHPFSFKV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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