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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003653`

染色体: Chr08 坐标: 40180513-40183905 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003653`
名称	SmilChr08G003653
描述	uncharacterized SmilChr08G003653
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	40180513 - 40183905 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996749`
GeneID	`130996749`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996749`
原始查询	`SmilChr08G003653`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TatD related DNase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824404]; symbol=AT3G52390; hit=AT3G52390; species=arabidopsis; confidence=high
产物	TatD related DNase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824404]; symbol=AT3G52390; hit=AT3G52390; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G52390` (AT3G52390) TatD related DNase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824404] identity=77.7; qcov=0.988; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0158200` - identity=76.5; qcov=0.991; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005829 (cytosol); GO:0008296 (3'-5'-DNA exonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF01026 (TatD_DNase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996749

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057778020.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057778020.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057778020.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778020.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778020.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:40181031`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C31
`Chr8:40181031`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C31
`Chr8:40181052`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr8:40181430`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr8:40182224`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778020.1

322 aa

161

322

TatD_DNase

PF01026 TatD_DNase 33-303 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778020.1`	Pfam	`PF01026`	TatD_DNase	Domain	33	303	2.3e-51	175.4	TatD related DNase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922037.1
ACAGGCAAAATCGTCATATGTCACGGGCGACATTGTTCGAAGAGTTGCTGTTTGGGTGCGCGCACACACACCCGCTCTCTCCAGTCTACACAAGCAGACAATTTCGTTTCTCTCAGAAGAATTGGCCATGGCGAGCAGCGGGAGTGTACGAATGATAGACATTGCCGTCAACTTCACAGATGGAATGTTCGGAGGAATTTACAACGGGAAGCAATATCACGTTGCTGATATTGCCGCTGTGCTTAGTAGGGCTTGGAGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996749
ATGGCGAGCAGCGGGAGTGTACGAATGATAGACATTGCCGTCAACTTCACAGATGGAATGTTCGGAGGAATTTACAACGGGAAGCAATATCACGTTGCTGATATTGCCGCTGTGCTTAGTAGGGCTTGGAGCGCCGGAGTCGATCGGATTATTGTGACAGGGGGCTCCCTTGAGGAGTCAAAAGAAGCTCTTGCTATTGCTGAAACTGATGCAAGACTTTTCTGCACAGTTGGGGTACACCCAACAAGATGTAAAGAATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778020.1
MASSGSVRMIDIAVNFTDGMFGGIYNGKQYHVADIAAVLSRAWSAGVDRIIVTGGSLEESKEALAIAETDARLFCTVGVHPTRCKEFDDSGDPERHFQALLSLAREGVDKGKVVAVGECGLDYDRLHFCPVEIQQKYFEKQFELAYAMKLPMFLHMRAAAEDFCNILERNKHRFFSGVAHSFTGSAEDRDRLLSFDNLFIGLNGCSLRNAENLDVVKGIPLDRLMIETDSPYCEIKNTHAGIKYVQSTWQFKKKEKYDPE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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