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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003665`

染色体: Chr08 坐标: 40461249-40462081 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003665`
名称	SmilChr08G003665
描述	uncharacterized SmilChr08G003665
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	40461249 - 40462081 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996762`
GeneID	`130996762`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996762`
原始查询	`SmilChr08G003665`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831835]; symbol=AT5G03450; hit=AT5G03450; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831835]; symbol=AT5G03450; hit=AT5G03450; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G03450` (AT5G03450) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831835] identity=32.5; qcov=0.647; evalue=4.72e-06; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0016567 (protein ubiquitination); GO:0036297 (interstrand cross-link repair); GO:0061630 (ubiquitin protein ligase activity)
KEGG	-
Pfam	PF13639 (zf-RING_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996762

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778039.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057778039.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778039.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778039.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778039.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:40461682`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,A13,C59,D1,D4
`Chr8:40461692`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr8:40461715`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,B84
`Chr8:40461716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B76,C21,C5,C73,C81
`Chr8:40461728`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,C13
`Chr8:40461830`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,C60
`Chr8:40461901`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,C60
`Chr8:40461916`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C2,C32,C68
`Chr8:40461954`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	B104,B113,B118,B134,B21,B42,B43,B94,C16
`Chr8:40461956`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	B104,B113,B118,B134,B21,B42,B43,B94,C16
`Chr8:40461960`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	B104,B113,B118,B134,B21,B42,B43,B94,C16
`Chr8:40461963`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B104,B113,B118,B134,B21,B42,B43,B94,C16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778039.1

119 aa

119

zf-RING_2

PF13639 zf-RING_2 59-103 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778039.1`	Pfam	`PF13639`	zf-RING_2	Domain	59	103	9.8e-08	32.9	Ring finger domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922056.1
ACTCCCATAATTTCACTCCACAACCATGGACCAAGACGACATGAGCATTGAAGACTATGTTGGCTGGCTGGAAAACCATTTCTCAAAGGCCAACATTTGCGATTTGTACGAAGAGTATGGAATTGACCGCCCCGAGAGTTCAGGTGTAAAAGACGATGATGAACACGAAATTGTGCCCAACAAAGACAACCTGCCAATCGAGTGCAAGCTTTGTGGTGAAGAGACTTACAAAAGTGAAGATCATGCAATTAGCGTGTTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996762
ATGGACCAAGACGACATGAGCATTGAAGACTATGTTGGCTGGCTGGAAAACCATTTCTCAAAGGCCAACATTTGCGATTTGTACGAAGAGTATGGAATTGACCGCCCCGAGAGTTCAGGTGTAAAAGACGATGATGAACACGAAATTGTGCCCAACAAAGACAACCTGCCAATCGAGTGCAAGCTTTGTGGTGAAGAGACTTACAAAAGTGAAGATCATGCAATTAGCGTGTTGCCATGCGGAGATGTATTTGGATTTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778039.1
MDQDDMSIEDYVGWLENHFSKANICDLYEEYGIDRPESSGVKDDDEHEIVPNKDNLPIECKLCGEETYKSEDHAISVLPCGDVFGFSCIFLAVEKEKKCPKCNAHFDTEDIITLQFGDD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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