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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003666`

染色体: Chr08 坐标: 40475763-40479116 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003666`
名称	SmilChr08G003666
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	40475763 - 40479116 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998470`
GeneID	`130998470`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998470`
原始查询	`SmilChr08G003666`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=29.1; qcov=0.829; evalue=1.43e-93; confidence=low
Rice	`Os06g0166100` - identity=33.1; qcov=0.728; evalue=1.76e-113; confidence=low
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998470

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779873.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779873.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779873.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779873.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779873.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:40475794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr8:40475804`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B127,B27,B45,B56,B68,C43
`Chr8:40475825`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B130,B63,C53
`Chr8:40475834`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr8:40475957`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B63,C27
`Chr8:40475974`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr8:40475990`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	79	A1,A14,A19,A6,A7,A8,B10,B100,B102,B103,B106,B109,B11,B113,B114,B119,B121,B123,B134,B138,B2,B20,B26,B29,B3,B34,B37,B40,B41,B45,B5,B54,B58,B61,B65,B66,B7,B72,B73,B79,B80,B83,B87,B89,B91,B94,B97,B98,C12,C15,C20,C24,C26,C28,C29,C3,C38,C40,C47,C50,C51,C56,C6,C60,C61,C64,C66,C76,C77,C78,C8,C80,C81,C82,C83,D1,D10,D2,D9
`Chr8:40475997`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	19	A22,A23,A5,B124,B63,B68,B70,B71,B79,B81,C32,C48,C60,C61,C65,C68,C85,C86,C87
`Chr8:40476108`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	178	A10,A11,A13,A14,A15,A18,A19,A2,A20,A22,A23,A25,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B117,B118,B12,B120,B121,B123,B124,B128,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B18,B20,B21,B22,B23,B25,B27,B3,B30,B33,B34,B35,B37,B4,B40,B41,B44,B45,B46,B47,B48,B5,B50,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B59,B6,B60,B61,B63,B64,B65,B66,B67,B69,B70,B71,B72,B73,B74,B76,B77,B79,B80,B82,B83,B86,B87,B88,B89,B92,B95,B96,B98,C1,C15,C16,C19,C20,C21,C22,C24,C25,C27,C29,C3,C31,C32,C36,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C51,C53,C55,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C66,C67,C68,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C76,C79,C81,C82,C83,C84,C87,C9,D11,D2,D3,D4,D6,D7,D8
`Chr8:40476122`	`CT`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B124,B59,B62,B93
`Chr8:40476124`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	B138,B14,B73,B85,C19,C64,C76,D6
`Chr8:40476133`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,B65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779873.1

805 aa

402

805

FAR1

MULE

SWIM

PF03101 FAR1 100-189 aa PF10551 MULE 313-407 aa PF04434 SWIM 606-623 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779873.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	100	189	1.7e-17	64.6	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057779873.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	313	407	2.4e-27	95.9	MULE transposase domain
`XP_057779873.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	606	623	0.00053	20.2	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923890.1
TCTCTCATATGGTTGTGGAGTGAAATTTAGTTCATTTCTTAGGTGAAGTGCGGCGTTTTTTTCCGGTGAAGTTCAGCTTGGGTGTTTCTCGGCGAAGCTATGTTGAAAAAACTGATCTAGGGAGATGGACTTCGATTTGAATATACCCGTAGGCCTTGATGATTTTGGCGATTCTTTGAGTGGCAATTCAAATTTTGGTGAATTTGGTAGTTTATTTTCAGGTGGTGAGACTGATGAATCAGTAGAAAGTTATTCAGCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998470
ATGGACTTCGATTTGAATATACCCGTAGGCCTTGATGATTTTGGCGATTCTTTGAGTGGCAATTCAAATTTTGGTGAATTTGGTAGTTTATTTTCAGGTGGTGAGACTGATGAATCAGTAGAAAGTTATTCAGCAGAAAGTGTGGATTTGGATAGCATTTTGAATGGAAAGAGAGGTGATGGAAATGCTGAAGAGGTTGGGGATGTAAACAGTGGCGAGAAGTCATTGACGTTGCCGGAAGTGGAAGCTATGATTAGAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779873.1
MDFDLNIPVGLDDFGDSLSGNSNFGEFGSLFSGGETDESVESYSAESVDLDSILNGKRGDGNAEEVGDVNSGEKSLTLPEVEAMIRVGCAIDTLDEVFVLYATYARMIGFSARVGSNGYFNDRKTVSSKAYHCSCEGHPDKKASTSRIAAFKKHSYRSNCKARLRVSRADVDSPWVVTVFFKEHNHELAHPSESYLLRSARKIEHSQKTLLMAMKSSGIGVSRAYRFLEKEAGNRENIGFTRKDVYNELNRESAAMAKST...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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