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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003676`

染色体: Chr08 坐标: 40921802-40922920 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003676`
名称	SmilChr08G003676
描述	uncharacterized SmilChr08G003676
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	40921802 - 40922920 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998473`
GeneID	`130998473`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998473`
原始查询	`SmilChr08G003676`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
产物	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G01050` (AT2G01050) zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629] identity=27.8; qcov=0.454; evalue=4.1e-18; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998473

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779875.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057779875.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779875.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779875.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779875.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:40921819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B137,B29,C15
`Chr8:40921829`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B24,B56,C65,D4
`Chr8:40921830`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr8:40921832`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	B13,B140,B38,B66,B8,C44,C54,D5
`Chr8:40921865`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr8:40921879`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,C42,C54
`Chr8:40921904`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,C42
`Chr8:40921931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B38,B66
`Chr8:40921966`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	A16,B134,B15,B55,B7,B89,C40,C6,C62,C69,C71,C9
`Chr8:40922144`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B100,B127,B65,D5
`Chr8:40922166`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,B95
`Chr8:40922174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B15,B84,B95,C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923892.1
ATGCACAGCCCGCTGGCGCTGGATTCTGCCCAGTTTGTGGTCTCGGACAAGTCGGGACTTCATCTGCCAAAGGTTTCCAACAATTTTGAGAAAGGTTCAATGGATTCTACTACGGAGGGTTTCAAAACTGCCGTTACTGAGACTAGGGTTTCTTTAAACCTTAAAGAAACGACGGGGCAGGCTTCGAGTGTGGTTCATGTTGATGGCTATGCACAATCTTCAAGCCCTAAGAAATCGTTCCCGACTTTGATGAAGCCGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998473
ATGCACAGCCCGCTGGCGCTGGATTCTGCCCAGTTTGTGGTCTCGGACAAGTCGGGACTTCATCTGCCAAAGGTTTCCAACAATTTTGAGAAAGGTTCAATGGATTCTACTACGGAGGGTTTCAAAACTGCCGTTACTGAGACTAGGGTTTCTTTAAACCTTAAAGAAACGACGGGGCAGGCTTCGAGTGTGGTTCATGTTGATGGCTATGCACAATCTTCAAGCCCTAAGAAATCGTTCCCGACTTTGATGAAGCCGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779875.1
MHSPLALDSAQFVVSDKSGLHLPKVSNNFEKGSMDSTTEGFKTAVTETRVSLNLKETTGQASSVVHVDGYAQSSSPKKSFPTLMKPLQALWEVEKEWKLIPMGKSFYSIAFSCEEDKARVKSRPVWDLLAGTMRLREWVRNFNPYKEVSSLCQVWTRIYYLPLEYWTLDISTGIGRALGTPIKVDSVTALGEVGHYACILIEVDLAANLSEVLLIDSEECSFYVEFDFEHLPAFCSKCKLAGHSLDKCNKVKKRAESKPE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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