Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003682`

染色体: Chr08 坐标: 41067719-41069745 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003682`
名称	SmilChr08G003682
描述	aluminum-activated malate transporter 8-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	41067719 - 41069745 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997069`
GeneID	`130997069`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997069`
原始查询	`SmilChr08G003682`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aluminum-activated malate transporter 8-like
产物	aluminum-activated malate transporter 8-like
Arabidopsis	`AT3G11680` (AT3G11680) aluminum activated malate transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820340] identity=54.23; qcov=0.932; evalue=1.73e-143; confidence=high
Rice	`Os04g0417000` (OsALMT1) - identity=47.63; qcov=0.87; evalue=8.82e-133; confidence=high
GO	GO:0009705 (plant-type vacuole membrane); GO:0015743 (malate transport)
KEGG	-
Pfam	PF11744 (ALMT); PF13515 (FUSC_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997069

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057778323.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:41067906`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:41068030`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,B71,B89,C70
`Chr8:41068371`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,C32,C68
`Chr8:41068452`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B49,C32,C68
`Chr8:41068486`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B51,B52,C10,C59,C83
`Chr8:41069151`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr8:41069209`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	17	A1,A24,B100,B126,B132,B133,B138,B46,B47,B50,B55,B72,B89,C17,C2,C74,D3
`Chr8:41069360`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr8:41069434`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr8:41069509`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B19,B27,B4,D4,D6
`Chr8:41069510`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778323.1

455 aa

228

455

ALMT

FUSC_2

PF11744 ALMT 33-376 aa PF13515 FUSC_2 57-196 aa

XP_057778324.1

448 aa

224

448

ALMT

FUSC_2

PF11744 ALMT 33-369 aa PF13515 FUSC_2 57-196 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778323.1`	Pfam	`PF11744`	ALMT	Family	33	376	1.5e-137	460.0	Aluminium activated malate transporter
`XP_057778323.1`	Pfam	`PF13515`	FUSC_2	Family	57	196	1.3e-08	35.7	Fusaric acid resistance protein-like
`XP_057778324.1`	Pfam	`PF11744`	ALMT	Family	33	369	4.4e-133	445.3	Aluminium activated malate transporter
`XP_057778324.1`	Pfam	`PF13515`	FUSC_2	Family	57	196	1.3e-08	35.8	Fusaric acid resistance protein-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922341.1
ATCCGGAGTCCACCCAGGTCCACACAAGTCTTCCCTTTCTCTCTCCACTATCGTACTTGCATGTATCCATGGAGACTACCTCAGCTACCAACCATGAAAAAACACGCTCTAATTTGTTCGAAAATGTTAAGGTTAGGCTGATGGAGACAGCGAAGAATACGAAGAAAATCGGAGAAGATGATCCCAGGAGAATCTTTCACTCCGTTAAGGTTGGATTCACTCTGACGTTAGTGTCTTTGTTTTACTACTTCAGACCACTC...

XM_057922340.1
CCGGAGTCCACCCAGGTCCACACAAGTCTTCCCTTTCTCTCTCCACTATCGTACTTGCATGTATCCATGGAGACTACCTCAGCTACCAACCATGAAAAAACACGCTCTAATTTGTTCGAAAATGTTAAGGTTAGGCTGATGGAGACAGCGAAGAATACGAAGAAAATCGGAGAAGATGATCCCAGGAGAATCTTTCACTCCGTTAAGGTTGGATTCACTCTGACGTTAGTGTCTTTGTTTTACTACTTCAGACCACTCTA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057778323.1_44917
ATGGAGACTACCTCAGCTACCAACCATGAAAAAACACGCTCTAATTTGTTCGAAAATGTTAAGGTTAGGCTGATGGAGACAGCGAAGAATACGAAGAAAATCGGAGAAGATGATCCCAGGAGAATCTTTCACTCCGTTAAGGTTGGATTCACTCTGACGTTAGTGTCTTTGTTTTACTACTTCAGACCACTCTACAATGGCTTCGGACAAGCCGGAATGTGGGCCATTTTGACCGTCGTCGTCGTCTTCGAATTCTCAGT...

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057778324.1_44918
ATGGAGACTACCTCAGCTACCAACCATGAAAAAACACGCTCTAATTTGTTCGAAAATGTTAAGGTTAGGCTGATGGAGACAGCGAAGAATACGAAGAAAATCGGAGAAGATGATCCCAGGAGAATCTTTCACTCCGTTAAGGTTGGATTCACTCTGACGTTAGTGTCTTTGTTTTACTACTTCAGACCACTCTACAATGGCTTCGGACAAGCCGGAATGTGGGCCATTTTGACCGTCGTCGTCGTCTTCGAATTCTCAGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057778323.1
METTSATNHEKTRSNLFENVKVRLMETAKNTKKIGEDDPRRIFHSVKVGFTLTLVSLFYYFRPLYNGFGQAGMWAILTVVVVFEFSVGGTISKSLNRGGATLLAGALGVGAEYLANLCGERGEPIVLGLLVFILAAVSTFTRFIPNVKRRYDYGVLIFILTFSLVAVSGARISEIMELAHQRLSTILIGGATCIVVSLCIYPVWAGQDLHHLIASNIQNLSASLQGFGNEFGDVVSSKDGRDKSYHQIHKSVLNSKATEE...

XP_057778324.1
METTSATNHEKTRSNLFENVKVRLMETAKNTKKIGEDDPRRIFHSVKVGFTLTLVSLFYYFRPLYNGFGQAGMWAILTVVVVFEFSVGGTISKSLNRGGATLLAGALGVGAEYLANLCGERGEPIVLGLLVFILAAVSTFTRFIPNVKRRYDYGVLIFILTFSLVAVSGARISEIMELAHQRLSTILIGGATCIVVSLCIYPVWAGQDLHHLIASNIQNLSASLQGFGNEFGDVVSSKDGRDKSYHQIHKSVLNSKATEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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