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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003685`

染色体: Chr08 坐标: 41137496-41139677 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003685`
名称	SmilChr08G003685
描述	uncharacterized SmilChr08G003685
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	41137496 - 41139677 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998474`
GeneID	`130998474`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998474`
原始查询	`SmilChr08G003685`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0714225; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os01g0714225; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT5G42905` (AT5G42905) Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834302] identity=27.8; qcov=0.424; evalue=5.17e-09; confidence=low
Rice	`Os01g0714225` - identity=43.1; qcov=0.114; evalue=1.52e-11; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998474

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057779877.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057779877.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057779877.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057779877.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779877.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:41137736`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,C23,C31
`Chr8:41137876`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B51,B52,C10,C59,C83
`Chr8:41137906`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,C23,C31
`Chr8:41137968`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A13,C23,C31
`Chr8:41137968`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,C23,C31
`Chr8:41137988`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr8:41138025`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr8:41138092`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B19,B22,B27,D4,D6
`Chr8:41138146`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr8:41138163`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:41138177`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:41138181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779877.1

568 aa

284

568

RVT_3

PF13456 RVT_3 416-535 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779877.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	416	535	4e-13	50.1	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923894.1
ATGATGATTGAAGATGTCAACTCAACTGAAGACTTTGCACAAGTCCAGAACAAAGAAGAGATGCAGATTCAACTGAAGAAAACTGCATCAGAAGTAGTTGAGGGATCGCTTCATATGACTTACTTGGGAGTTCCTCTGTTTATAGGTCGGTCGCGTGCTTCTCATTTTATGAGTATCAAGGATAGGATTGTGCAGAAGTTCTCTAGATGGAAAGGAAGGCAGTTGTCTATGGCTGGGCGCTTGTGTCTGGTTCAATCTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998474
ATGATGATTGAAGATGTCAACTCAACTGAAGACTTTGCACAAGTCCAGAACAAAGAAGAGATGCAGATTCAACTGAAGAAAACTGCATCAGAAGTAGTTGAGGGATCGCTTCATATGACTTACTTGGGAGTTCCTCTGTTTATAGGTCGGTCGCGTGCTTCTCATTTTATGAGTATCAAGGATAGGATTGTGCAGAAGTTCTCTAGATGGAAAGGAAGGCAGTTGTCTATGGCTGGGCGCTTGTGTCTGGTTCAATCTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779877.1
MMIEDVNSTEDFAQVQNKEEMQIQLKKTASEVVEGSLHMTYLGVPLFIGRSRASHFMSIKDRIVQKFSRWKGRQLSMAGRLCLVQSVIQSSIDHSMMIFRWPKSLLHYLDKNTVGILCGPRLIKGEDFIFKILRSRYLDEFCMAKTSVAWSSVWLGLKPEIGELVDNSHSLVGHGHHTRFWTDDWLGYKICDKLAIPSFMHEFLGQSVADYFFHGIWHFSANFVENYPEVVVDIITFPFDGDKDVRVWKSSPYGDVTAVL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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