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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003686`

染色体: Chr08 坐标: 41141133-41147193 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003686`
名称	SmilChr08G003686
描述	protein LEAD-SENSITIVE 1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	41141133 - 41147193 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997072`
GeneID	`130997072`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997072`
原始查询	`SmilChr08G003686`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein LEAD-SENSITIVE 1
产物	protein LEAD-SENSITIVE 1
Arabidopsis	`AT5G06370` (AT5G06370) NC domain-containing protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830525] identity=79.8; qcov=0.977; evalue=9.48e-154; confidence=high
Rice	`Os05g0440100` - identity=71.3; qcov=1.03; evalue=8.47e-135; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04970 (LRAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997072

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057778326.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.60000	`XP_057778326.1`
3	Mitochondrion outer membrane	线粒体外膜	0.40000	`XP_057778326.1`
4	Lipid droplet	脂滴	0.40000	`XP_057778326.1`
5	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057778326.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:41145711`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:41146376`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:41146550`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B49,C32,C68
`Chr8:41146696`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778326.1

258 aa

129

258

LRAT

PF04970 LRAT 12-164 aa

XP_057778327.1

258 aa

129

258

LRAT

PF04970 LRAT 12-164 aa

XP_057778328.1

258 aa

129

258

LRAT

PF04970 LRAT 12-164 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778326.1`	Pfam	`PF04970`	LRAT	Domain	12	164	2.1e-27	96.5	Lecithin retinol acyltransferase
`XP_057778327.1`	Pfam	`PF04970`	LRAT	Domain	12	164	2.1e-27	96.5	Lecithin retinol acyltransferase
`XP_057778328.1`	Pfam	`PF04970`	LRAT	Domain	12	164	2.1e-27	96.5	Lecithin retinol acyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922343.1
ATTATATTATAAATTAAAATTAAATACAGAGCTTAAAATCAAATCAAATAACTGAAATTGTAGGTGTGTAGTCTAGAAACCCTGTCCAGCCTCTCCCTCTCAGCTCGGTCGGCACCGTCCTCACCCTATGCGCGGCACGGATGCAGGCCTCCCGGCCCTCTCACCTCTCGATCTCGGCGTCTCTTCTTCCTCAGCTCAGGCGCGGCGGAGCCCTCAACCCACCCCCTACGAGGCCGCGCGTCGCTGCCAGCACTCTCCCC...

XM_057922344.1
ACAGAGCTTAAAATCAAATCAAATAACTGAAATTGTAGGTGTGTAGTCTAGAAACCCTGTCCAGCCTCTCCCTCTCAGCTCGGTCGGCACCGTCCTCACCCTATGCGCGGCACGGATGCAGGCCTCCCGGCCCTCTCACCTCTCGATCTCGGCGTCTCTTCTTCCTCAGCTCAGGCGCGGCGGAGCCCTCAACCCACCCCCTACGAGGCCGCGCGTCGCTGCCAGCACTCTCCCCTCCCACTCGGCCCTCCTCAGGTTTT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130997072
ATGGGGCTGCTCTCAAATAGAATCGGAAGGAGCAGTCTAAAGCCAGGGGATCATATCTACTCGTGGCGGACTGCATATATCTATGCTCATCACGGTATTTATCTTGGAGATGATAAAGTTATACATTTCACCAGACGAGGCCAAGAAGTCGGGACTGGTACCATGTTAGATGTCCTGCTGGTGAGCTCAGGACCGAATCGATCATATGTGCCGTGCCCCACCTGTGTCACAAGAGACGATGCCCATGGAGTAGTCTCGTC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057778326.1
MGLLSNRIGRSSLKPGDHIYSWRTAYIYAHHGIYLGDDKVIHFTRRGQEVGTGTMLDVLLVSSGPNRSYVPCPTCVTRDDAHGVVSSCLNCFLAGGILYRFEYSVSAALFLAKARGGTCTLAVSDPDVDVIHRAKYLLENGFGCYNVFKNNCEDFAIYCKTGLLVLDQSTMGQSGQAVSIIGGPLAAVLSTPLRLVTTNIYGMAATAVGVYCVSRYAADIGMRRDVVKVPVEDLTTRLATGMLQVLEPSLPAAPALAH

XP_057778327.1
MGLLSNRIGRSSLKPGDHIYSWRTAYIYAHHGIYLGDDKVIHFTRRGQEVGTGTMLDVLLVSSGPNRSYVPCPTCVTRDDAHGVVSSCLNCFLAGGILYRFEYSVSAALFLAKARGGTCTLAVSDPDVDVIHRAKYLLENGFGCYNVFKNNCEDFAIYCKTGLLVLDQSTMGQSGQAVSIIGGPLAAVLSTPLRLVTTNIYGMAATAVGVYCVSRYAADIGMRRDVVKVPVEDLTTRLATGMLQVLEPSLPAAPALAH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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