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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003694`

染色体: Chr08 坐标: 41321204-41324692 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003694`
名称	SmilChr08G003694
描述	protein CHROMOSOME TRANSMISSION FIDELITY 7-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	41321204 - 41324692 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997077`
GeneID	`130997077`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997077`
原始查询	`SmilChr08G003694`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein CHROMOSOME TRANSMISSION FIDELITY 7-like
产物	protein CHROMOSOME TRANSMISSION FIDELITY 7-like
Arabidopsis	`AT4G31400` (CTF7) protein CTF7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829267] identity=48.2; qcov=0.791; evalue=1.79e-82; confidence=high
Rice	`Os04g0498900` - identity=49.3; qcov=0.742; evalue=3.99e-80; confidence=high
GO	GO:0000785 (chromatin); GO:0005634 (nucleus); GO:0007064 (mitotic sister chromatid cohesion); GO:0061733 (protein-lysine-acetyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF13878 (zf-C2H2_3); PF13880 (Acetyltransf_13)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997077

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778333.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057778333.1`
3	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057778333.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057778333.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778333.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:41322206`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:41322243`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B128,B26,C87,D11
`Chr8:41322906`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr8:41323058`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B2
`Chr8:41323058`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B2
`Chr8:41323264`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B63,B8,C51,C57
`Chr8:41323666`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,D10
`Chr8:41323764`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,C13,C22,C4
`Chr8:41323780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr8:41323803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:41323850`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:41324254`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	108	A13,A16,A18,A20,A21,A23,B100,B101,B102,B104,B107,B108,B11,B112,B115,B118,B119,B12,B123,B125,B126,B129,B13,B130,B131,B132,B134,B137,B140,B15,B17,B18,B20,B21,B23,B24,B29,B3,B31,B33,B34,B38,B39,B40,B42,B43,B45,B5,B51,B52,B56,B6,B60,B61,B63,B64,B72,B74,B76,B77,B79,B81,B86,B88,B9,B91,B93,B95,B96,B97,C10,C12,C17,C18,C19,C21,C22,C23,C26,C28,C3,C31,C32,C44,C45,C47,C5,C53,C54,C59,C61,C65,C68,C7,C70,C77,C81,C82,C83,C84,C85,C86,D2,D4,D5,D7,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778333.1

383 aa

192

383

zf-C2H2_3

Acetyltransf_13

PF13878 zf-C2H2_3 80-119 aa PF13880 Acetyltransf_13 264-300 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778333.1`	Pfam	`PF13878`	zf-C2H2_3	Domain	80	119	6.5e-12	45.8	zinc-finger of acetyl-transferase ESCO
`XP_057778333.1`	Pfam	`PF13880`	Acetyltransf_13	Domain	264	300	6.1e-13	49.1	ESCO1/2 acetyl-transferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922350.1
AAGAACGGCAAAATCCCCTAATTTCGGTTCACAACCGCTCTCACCGCGCGCCTCCGCCAGACGCTAGCAGCTTCGCCTCACTACACCTTCTTCCCACCGCGACGCGCATCCAGTCGTTTCGCCGCGCCTCCTCCGTTCGATACTCTGCAGCAGTAGATGGGGTTTTTTTTTTTAAAAAAAAAAAATTGTTTTTAATCATTTTCTGAATTTGTTCCTTCTCGCTGCATATTTGTATATTAAATTAAACACGCATGGAAGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997077
ATGCAGCCAAAGATTAATGACTTCTTCAAGCCGTCGCCTTCTAACTTACCGGAATCGTCTCCATTTTCCGCTGTTGCCGGAGAATCAACCACAGAACCAGAATCCGACGTCTGCTATAAACACGCACGTTCTGATCCAGAAGGAGAAACATCCAATGGACATGATCTTGAGGACAAGCTTCCCAAATTGGAGCAAGGCAAGAGTTGCAAAATTTTGAATAAGAAGAGAAAGTATGCACAGCTATTCTTGGAAGTTGGACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778333.1
MQPKINDFFKPSPSNLPESSPFSAVAGESTTEPESDVCYKHARSDPEGETSNGHDLEDKLPKLEQGKSCKILNKKRKYAQLFLEVGQSDFLFHTCKVCSFKYAPGDEVDEKVHKTIHKNYTLGLPFKGWRNERVIDELDKGRIILVQDGDPPAQLKKVEDVVQMIETELGEGWILNKQCKVYLFISSQRVSGCLVAEPIKMAYKLLPSSLVEKSNFPAKEKKRTSSILQFGGVSLQREVIKREHAKHPEDGTHDGTILCK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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