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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003705`

染色体: Chr08 坐标: 41546083-41547724 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003705`
名称	SmilChr08G003705
描述	uncharacterized SmilChr08G003705
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	41546083 - 41547724 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997086`
GeneID	`130997086`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997086`
原始查询	`SmilChr08G003705`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997086

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778342.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778342.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778342.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778342.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057778342.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:41546693`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,C68
`Chr8:41546713`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,C25,C59
`Chr8:41546739`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C23,C86
`Chr8:41546739`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C23,C86
`Chr8:41546752`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	A1,C32
`Chr8:41546752`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	A1,C32
`Chr8:41546774`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr8:41546787`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B90,C48
`Chr8:41546788`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr8:41546790`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B90
`Chr8:41546804`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,C12,C18
`Chr8:41546812`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A24,B114,B40,B46,B51,B81,C33,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778342.1

229 aa

114

229

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 56-178 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778342.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	56	178	1.9e-12	48.2	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009092949.1
TTAAGGTATTTTCTTAATTTTCTGATGGCAAGACATGTGAAAGTGAAGCTTCATCTTATTTTATATCTTATGCTTTGGAATACATTTGATTGAAAACAAATGCAGGAATGTTTCTCAAATCCAAATATTGAGTTATATCGTGAGCATACGTTGGAGCATATGAGTGTTTTGTGGGGAGCTTGGAGATCAAAATTGTATGCAGATCACGTGAAACCTTACAAAAACAAGATCAATGCTTTAAAAAAGGTTCCACGTGGGAT...

XM_057922359.1
TTAAGGTATTTTCTTAATTTTCTGATGGCAAGACATGTGAAAGTGAAGCTTCATCTTATTTTATATCTTATGCTTTGGAATACATTTGATTGAAAACAAATGCAGGAATGTTTCTCAAATCCAAATATTGAGTTATATCGTGAGCATACGTTGGAGCATATGAGTGTTTTGTGGGGAGCTTGGAGATCAAAATTGTATGCAGATCACGTGAAACCTTACAAAAACAAGATCAATGCTTTAAAAAAGGTTCCACGTGGGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997086
ATGCAGGAATGTTTCTCAAATCCAAATATTGAGTTATATCGTGAGCATACGTTGGAGCATATGAGTGTTTTGTGGGGAGCTTGGAGATCAAAATTGTATGCAGATCACGTGAAACCTTACAAAAACAAGATCAATGCTTTAAAAAAGGTTCCACGTGGGATGAATGATAAAGATTGGGAATGGCTCGTAACTAACAAGTTTCTAACTAAAGAGTTTCAGGATATCAGTGACCGAAATTCTAAGAATCGATCAAAATCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778342.1
MQECFSNPNIELYREHTLEHMSVLWGAWRSKLYADHVKPYKNKINALKKVPRGMNDKDWEWLVTNKFLTKEFQDISDRNSKNRSKSDLFMPHLTVSRPHRDIIYDKGGKNSEMPDLGVIFFETRSKNGKFKGTKEKDKYDEIVETIQSNPSLSNLELAEKCFGPQQHGIVYGYGGGVKRKTFHDWKSSYTKELEEKLSAKDEENRLLRKRVDRLEERFDQWERSGLPSE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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