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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003713`

染色体: Chr08 坐标: 41734426-41735118 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003713`
名称	SmilChr08G003713
描述	uncharacterized SmilChr08G003713
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	41734426 - 41735118 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998487`
GeneID	`130998487`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998487`
原始查询	`SmilChr08G003713`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0522300; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os02g0522300; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os02g0522300` - identity=37.4; qcov=0.743; evalue=4.52e-29; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF24626 (SH3_Tf2-1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998487

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779887.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057779887.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057779887.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779887.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779887.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:41734432`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	20	B120,B132,B22,B33,B40,B57,B67,B68,B74,C32,C40,C46,C53,C64,C66,C68,C80,C84,D1,D2
`Chr8:41734435`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	26	A10,B100,B118,B119,B139,B28,B29,B30,B31,B44,B48,B54,B63,B7,B77,B83,C14,C16,C26,C38,C39,C41,C52,C60,D10,D5
`Chr8:41734442`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B54,B7,B86
`Chr8:41734469`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	11	B12,B120,B132,B40,B58,B60,B74,C32,C40,C68,D1
`Chr8:41734501`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B56,C26,C55
`Chr8:41734501`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B56,C26,C55
`Chr8:41734551`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	B12,B120,B132,B40,B58,B60,B74,C32,C40,C68,D1
`Chr8:41734584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr8:41734640`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C29,C71
`Chr8:41734649`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr8:41734652`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B43,C31
`Chr8:41734715`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	B105,B112,B113,B24,B71,B82,B99,C10,C30,C46,C9,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779887.1

230 aa

115

230

SH3_Tf2-1

PF24626 SH3_Tf2-1 44-105 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779887.1`	Pfam	`PF24626`	SH3_Tf2-1	Domain	44	105	4.7e-22	78.6	Tf2-1-like, SH3 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923904.1
ATGGATGGCCAGCGCAGAGCTGAGTTCATGAGGCAGGTACATGAGAGGGCCCGAGCTAACATCGAGCGCCGCACACGGCAGTATGCAGAGCAGGCTAATCAAGGCCGTCGCAAGGTGGTGTTCGAGCTCGGTGATTGGGTTTGGCTTCACATGCGCAAGGAACGATTTCTAGAGCAGCGGCGTTCCAAGTTGCTTCCTAGGGGAGATGGACCATTTCAAGTATTGGAACGGATCAATGATAATGCCTACAAACTAGACTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998487
ATGGATGGCCAGCGCAGAGCTGAGTTCATGAGGCAGGTACATGAGAGGGCCCGAGCTAACATCGAGCGCCGCACACGGCAGTATGCAGAGCAGGCTAATCAAGGCCGTCGCAAGGTGGTGTTCGAGCTCGGTGATTGGGTTTGGCTTCACATGCGCAAGGAACGATTTCTAGAGCAGCGGCGTTCCAAGTTGCTTCCTAGGGGAGATGGACCATTTCAAGTATTGGAACGGATCAATGATAATGCCTACAAACTAGACTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779887.1
MDGQRRAEFMRQVHERARANIERRTRQYAEQANQGRRKVVFELGDWVWLHMRKERFLEQRRSKLLPRGDGPFQVLERINDNAYKLDLPGEYNVSATFNVTDLSPFDVGDAVDLRTNPLQEGGNDAVQSRALDTAQSRAPNAVQSRDPMHVPIGPVTRARAKTFKANLMALVEEIWKQELRKPNGERPPEQSSRVVNLVTYRVEHTGRAEQTCKAEQTCRAEVFRAGVFLS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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