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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003721`

染色体: Chr08 坐标: 41867224-41869050 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003721`
名称	SmilChr08G003721
描述	uncharacterized SmilChr08G003721
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	41867224 - 41869050 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998490`
GeneID	`130998490`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998490`
原始查询	`SmilChr08G003721`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6240332]; symbol=AT2G06541; hit=AT2G06541; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6240332]; symbol=AT2G06541; hit=AT2G06541; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G06541` (AT2G06541) TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6240332] identity=44.7; qcov=0.976; evalue=3.85e-100; confidence=medium
Rice	`Os02g0301400` - identity=37.7; qcov=0.837; evalue=2.22e-62; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14291 (DUF4371); PF27073 (FAM200-ZBED5_RNase-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998490

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057779891.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057779891.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779891.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779891.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779891.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:41867229`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	45	A11,A15,A3,B10,B102,B105,B108,B113,B122,B128,B131,B16,B24,B26,B33,B34,B38,B39,B45,B56,B58,B69,B73,B93,B96,B97,C16,C28,C33,C34,C38,C39,C46,C58,C59,C63,C65,C67,C73,C80,C81,C82,D1,D4,D6
`Chr8:41867239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr8:41867253`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,C15
`Chr8:41867255`	`A`	`AAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B54,C15
`Chr8:41867255`	`A`	`AAC`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B54,C15
`Chr8:41867257`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B54,C15
`Chr8:41867257`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B54,C15
`Chr8:41867314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B86,C47,C53
`Chr8:41867317`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	42	A18,A19,A21,A4,A7,A9,B105,B123,B126,B135,B16,B21,B27,B3,B30,B35,B37,B40,B46,B47,B53,B55,B65,B74,B78,B83,B94,B96,C16,C19,C23,C27,C31,C35,C37,C53,C58,C77,C79,C82,D3,D6
`Chr8:41867322`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C57
`Chr8:41867322`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C57
`Chr8:41867324`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	19	A14,A15,A5,B130,B137,B14,B16,B5,B54,B62,B87,C25,C27,C58,C59,C70,C73,C75,C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779891.1

374 aa

187

374

DUF4371

FAM200-ZBED5_RNase-like

PF14291 DUF4371 7-236 aa PF27073 FAM200-ZBED5_RNase-like 152-241 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779891.1`	Pfam	`PF14291`	DUF4371	Domain	7	236	1.2e-101	340.0	ZMYM1/FAM200, RNase-like domain
`XP_057779891.1`	Pfam	`PF27073`	FAM200-ZBED5_RNase-like	Domain	152	241	6.8e-12	46.1	FAM200/ZBED5 RNase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923908.1
ATGGCGACTTTGTTGGTGAAAGGTTTAGGAACTGGAAAAAAGGGGGAAAGGCTGAAAGAACATGTCGAAGGTCCTAATAGTGCTCATAACAAAGCTTGGGCTCAATGTGAAGCTTTGAAAAATCAGAAACAACATATTCAGTATGCATTTGACAAGCAGACAGATCAAAATCGAAGAGATTATCGAATAAGGTTAAATACATCAATTGATTGTGTTCGATTTCTTTTACGTCAAGGACTTGCATTCCGTGGTGATGATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998490
ATGGCGACTTTGTTGGTGAAAGGTTTAGGAACTGGAAAAAAGGGGGAAAGGCTGAAAGAACATGTCGAAGGTCCTAATAGTGCTCATAACAAAGCTTGGGCTCAATGTGAAGCTTTGAAAAATCAGAAACAACATATTCAGTATGCATTTGACAAGCAGACAGATCAAAATCGAAGAGATTATCGAATAAGGTTAAATACATCAATTGATTGTGTTCGATTTCTTTTACGTCAAGGACTTGCATTCCGTGGTGATGATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779891.1
MATLLVKGLGTGKKGERLKEHVEGPNSAHNKAWAQCEALKNQKQHIQYAFDKQTDQNRRDYRIRLNTSIDCVRFLLRQGLAFRGDDESKNSANRGNFLELLSFLADHNDDIKYVINGAPENLKLIAPSIQKDIMNAAAVKTINVIMEEIGGALFSILVDESRDISMKEQMSIVLRFVNKDACIVERFVGVEHVTSTTALALKEAIDCFFSRHNLSISRLRGQGYDGASNMQGAFNGLKALILKENPCAFYIHCFAHQLQL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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