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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003725`

染色体: Chr08 坐标: 41972557-41977123 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003725`
名称	SmilChr08G003725
描述	transcription initiation factor TFIID subunit 15
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	41972557 - 41977123 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997100`
GeneID	`130997100`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997100`
原始查询	`SmilChr08G003725`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription initiation factor TFIID subunit 15
产物	transcription initiation factor TFIID subunit 15
Arabidopsis	`AT1G50300` (TAF15) TBP-associated factor 15 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841452] identity=70.8; qcov=0.832; evalue=3.45e-135; confidence=high
Rice	`Os07g0296200` (B1272H04.13-1) - identity=66.9; qcov=1.05; evalue=2.91e-136; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF00641 (Zn_ribbon_RanBP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997100

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778347.1`
2	Nuclear speckle	核斑点	1.00000	`XP_057778347.1`
3	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057778347.1`
4	Chromatin	染色质	0.40000	`XP_057778347.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778347.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:41973686`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B77
`Chr8:41975272`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B118,B125,C17,D9
`Chr8:41976851`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778347.1

382 aa

191

382

RRM_1

Zn_ribbon_RanBP

PF00076 RRM_1 15-92 aa PF00641 Zn_ribbon_RanBP 149-178 aa PF00641 Zn_ribbon_RanBP 219-245 aa

XP_057778348.1

382 aa

191

382

RRM_1

Zn_ribbon_RanBP

PF00076 RRM_1 15-92 aa PF00641 Zn_ribbon_RanBP 149-178 aa PF00641 Zn_ribbon_RanBP 219-245 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778347.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	15	92	9.5e-09	35.7	RNA recognition motif
`XP_057778347.1`	Pfam	`PF00641`	Zn_ribbon_RanBP	Domain	149	178	1.2e-10	41.2	Zn-finger in Ran binding protein and others
`XP_057778347.1`	Pfam	`PF00641`	Zn_ribbon_RanBP	Domain	219	245	1.2e-10	41.2	Zn-finger in Ran binding protein and others
`XP_057778348.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	15	92	9.5e-09	35.7	RNA recognition motif
`XP_057778348.1`	Pfam	`PF00641`	Zn_ribbon_RanBP	Domain	149	178	1.2e-10	41.2	Zn-finger in Ran binding protein and others
`XP_057778348.1`	Pfam	`PF00641`	Zn_ribbon_RanBP	Domain	219	245	1.2e-10	41.2	Zn-finger in Ran binding protein and others

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922364.1
CTGATGTAAATGGAATTACGTTTGTGTCCCAGGGTATATTTGCGATTGACTCGATCCCTTCGCGGCCAAAAATCCCCATTCTTTCCTCATCTATCTCAACCGGCAGTGAACCTGCGACGGCGGCGGCGCCACACCGGAGAAATCAGTTGGGGTGGTTGATAGAGTGGTGATTTGGTGCTTGAATTATTGTTGTGGTGGCGGTGCTTCATGAATTTGGAGCGGAATGGCCAACTATTCTGGAAAAGGGGCGCCGACGAACG...

XM_057922365.1
TGACTCGATCCCTTCGCGGCCAAAAATCCCCATTCTTTCCTCATCTATCTCAACCGGCAGTGAACCTGCGACGGCGGCGGCGCCACACCGGAGAAATCAGAGTGGTGATTTGGTGCTTGAATTATTGTTGTGGTGGCGGTGCTTCATGAATTTGGAGCGGAATGGCCAACTATTCTGGAAAAGGGGCGCCGACGAACGGGTCTGTTTATGTTTGTAACTTACCTCCCGGTACTGATGAGACAATGTTGGCCGAGCACTTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997100
ATGGCCAACTATTCTGGAAAAGGGGCGCCGACGAACGGGTCTGTTTATGTTTGTAACTTACCTCCCGGTACTGATGAGACAATGTTGGCCGAGCACTTCGGCACTATTGGCTTGCTGAAGAAAGACAAACGAACCGGGCGTCCAAAGATATGGCTATACCATGATAAAGTGACAAATGAGCCCAAAGGAGATGCCATGGTCACTTATGAGGATCCACATGCTGCACTGGCTGCTGTTGAATGGTTTAACAACAAAGATTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057778347.1
MANYSGKGAPTNGSVYVCNLPPGTDETMLAEHFGTIGLLKKDKRTGRPKIWLYHDKVTNEPKGDAMVTYEDPHAALAAVEWFNNKDFHGATIGVCMAESKNKDDTTNHVGDQAVVTDVNDLEEASVDVSDGGGRGRGRGDAGGKPWQQDGDWLCTNTSCGNVNFAFRGVCNRCGTARPAGASGGGAAGGGRGRGRGNSDAGGPARGAGAAGGGLFGPNDWPCPMCGNINWAKRTKCNICNTNKPGTSEGGVRGGRGGGYK...

XP_057778348.1
MANYSGKGAPTNGSVYVCNLPPGTDETMLAEHFGTIGLLKKDKRTGRPKIWLYHDKVTNEPKGDAMVTYEDPHAALAAVEWFNNKDFHGATIGVCMAESKNKDDTTNHVGDQAVVTDVNDLEEASVDVSDGGGRGRGRGDAGGKPWQQDGDWLCTNTSCGNVNFAFRGVCNRCGTARPAGASGGGAAGGGRGRGRGNSDAGGPARGAGAAGGGLFGPNDWPCPMCGNINWAKRTKCNICNTNKPGTSEGGVRGGRGGGYK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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