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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003726`

染色体: Chr08 坐标: 41982359-41982991 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003726`
名称	SmilChr08G003726
描述	uncharacterized SmilChr08G003726
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	41982359 - 41982991 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998492`
GeneID	`130998492`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998492`
原始查询	`SmilChr08G003726`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os06g0523701` - identity=33.5; qcov=0.852; evalue=2.1e-30; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	PF24964 (DUF7769)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998492

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779892.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057779892.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057779892.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779892.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779892.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:41982424`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	18	A25,B108,B110,B132,B19,B28,B37,B5,B57,C16,C23,C46,C51,C6,C61,C67,D4,D6
`Chr8:41982430`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:41982488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr8:41982507`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B72,C5
`Chr8:41982507`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,C5
`Chr8:41982509`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr8:41982515`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr8:41982524`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	172	A10,A11,A13,A14,A16,A18,A2,A20,A21,A22,A24,A25,A3,A4,A6,A7,A8,A9,B101,B102,B103,B104,B106,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B114,B117,B12,B121,B122,B123,B124,B125,B127,B128,B13,B130,B131,B135,B136,B138,B139,B14,B140,B15,B17,B19,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B3,B31,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B42,B44,B47,B48,B5,B50,B51,B52,B54,B55,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B67,B69,B70,B72,B75,B76,B77,B78,B8,B81,B82,B83,B85,B9,B90,B92,B93,B94,B95,B96,B99,C1,C10,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C20,C21,C22,C23,C24,C26,C27,C29,C3,C30,C32,C34,C35,C36,C37,C39,C41,C42,C43,C44,C45,C48,C49,C5,C50,C51,C53,C54,C55,C56,C57,C59,C6,C60,C61,C63,C64,C66,C68,C71,C72,C73,C74,C76,C77,C79,C81,C82,C84,C85,D11,D2,D5,D6,D8
`Chr8:41982576`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B68,B71,B80
`Chr8:41982605`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,B5
`Chr8:41982614`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A4,B124,B3,B34,C55
`Chr8:41982614`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B124,B3,B34,C55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779892.1

210 aa

105

210

DUF7769

PF24964 DUF7769 6-60 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779892.1`	Pfam	`PF24964`	DUF7769	Domain	6	60	1e-10	41.8	Domain of unknown function (DUF7769)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923909.1
ATGGTGAGCAAAAATCTTTCCAACCAAGAGAGGAATCGGATTGTGCAATATCTACTCCAAAATCTGAAAAACGGCAAGCCAAGGAAAGGAGCCATGAAGGAGGCTGTCTCCATCTTCAATTCTTCGAAACGTACGGTGACTCGTCTGTGGGCTGCAGCCAAGAAACAACACGATAAAGGTGACCAAATCTATTTAACAAGTGCAAAACCTAATGCACCTAGAAGAAAAAGAGTTCATGTAGACATAGAGCTCATTCAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998492
ATGGTGAGCAAAAATCTTTCCAACCAAGAGAGGAATCGGATTGTGCAATATCTACTCCAAAATCTGAAAAACGGCAAGCCAAGGAAAGGAGCCATGAAGGAGGCTGTCTCCATCTTCAATTCTTCGAAACGTACGGTGACTCGTCTGTGGGCTGCAGCCAAGAAACAACACGATAAAGGTGACCAAATCTATTTAACAAGTGCAAAACCTAATGCACCTAGAAGAAAAAGAGTTCATGTAGACATAGAGCTCATTCAAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779892.1
MVSKNLSNQERNRIVQYLLQNLKNGKPRKGAMKEAVSIFNSSKRTVTRLWAAAKKQHDKGDQIYLTSAKPNAPRRKRVHVDIELIQSLELHKRSTIRRLAMGINRSKNTVWRWVNQGLIRAHTSAIKPNLTAPNKLLRLQFSLEALVFDRIMMTLKFKAMNNTVHVDKKWFYITKVAHRFYLTPGEGDPHRTCKSKRQCKCGFRFWSWIF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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