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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003727`

染色体: Chr08 坐标: 42037967-42041329 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003727`
名称	SmilChr08G003727
描述	cytokinin riboside 5'-monophosphate phosphoribohydrolase LOG7-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	42037967 - 42041329 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997101`
GeneID	`130997101`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997101`
原始查询	`SmilChr08G003727`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytokinin riboside 5'-monophosphate phosphoribohydrolase LOG7-like
产物	cytokinin riboside 5'-monophosphate phosphoribohydrolase LOG7-like
Arabidopsis	`AT5G06300` (LOG7) Putative lysine decarboxylase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830518] identity=85.3; qcov=0.79; evalue=4.19e-135; confidence=high
Rice	`Os04g0518800` (LABA1) - identity=68.8; qcov=0.888; evalue=8.1e-115; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol); GO:0009691 (cytokinin biosynthetic process); GO:0016799 (hydrolase activity, hydrolyzing N-glycosyl compounds)
KEGG	-
Pfam	PF03641 (Lysine_decarbox); PF18306 (LDcluster4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997101

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057778349.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057778349.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057778349.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778349.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778349.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:42038057`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B13
`Chr8:42038057`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B13
`Chr8:42038078`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	B51,B52,B53,B72,B74,C10,C59,C83
`Chr8:42038089`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	39	A18,A2,A20,A22,A4,A9,B108,B117,B122,B128,B13,B131,B140,B19,B24,B36,B48,B52,B56,B58,B61,B62,B65,B70,B94,C14,C21,C39,C53,C64,C65,C66,C74,C79,C82,C84,D2,D4,D6
`Chr8:42038090`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B51,B52,B53,B72,C10,C59,C83
`Chr8:42038097`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	49	A13,A14,A16,A25,A5,A7,A9,B114,B118,B12,B121,B125,B130,B134,B16,B18,B24,B28,B34,B40,B42,B45,B46,B53,B57,B72,B74,B76,B87,B95,B99,C17,C20,C23,C25,C31,C36,C37,C42,C46,C5,C57,C70,C87,C9,D10,D5,D7,D9
`Chr8:42039870`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B51,C35
`Chr8:42039892`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr8:42041099`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778349.1

267 aa

134

267

LDcluster4

Lysine_decarbox

PF18306 LDcluster4 67-193 aa PF03641 Lysine_decarbox 105-234 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778349.1`	Pfam	`PF18306`	LDcluster4	Family	67	193	7.2e-14	52.4	SLOG cluster4 family
`XP_057778349.1`	Pfam	`PF03641`	Lysine_decarbox	Family	105	234	2.3e-49	167.6	Possible lysine decarboxylase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922366.1
GGTGGGGTGGGATGTTTTGGTATAAAACCTATTACACTATTGCTCAGTTTCTCATTCCTCATCTCCACAGTTGTAGGGCATCATTGATTTTCACACACACACGTATTTATAGACAGAGAGAGAGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAAGGAGATTCAAGAGAGTTGCAATGGAGATGGAGAAAGAATCAAGATTCAAAAGAATTTGTGTCTTCTGCGGCAGCAGTTCTGGCAAGAAACCAAGCTATCAAGAAGCTGCTATAGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997101
ATGTTTTGGTATAAAACCTATTACACTATTGCTCAGTTTCTCATTCCTCATCTCCACAGTTGTAGGGCATCATTGATTTTCACACACACACGTATTTATAGACAGAGAGAGAGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAAGGAGATTCAAGAGAGTTGCAATGGAGATGGAGAAAGAATCAAGATTCAAAAGAATTTGTGTCTTCTGCGGCAGCAGTTCTGGCAAGAAACCAAGCTATCAAGAAGCTGCTATAGAGTTGGGAAAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778349.1
MFWYKTYYTIAQFLIPHLHSCRASLIFTHTRIYRQRESVCERERRRFKRVAMEMEKESRFKRICVFCGSSSGKKPSYQEAAIELGKELVEKRIDLVYGGGSVGLMGLVSQAVHDGGRHVLGVIPRTLMPRELTGETVGEVRAVSDMHQRKAEMARHADAFIALPGGYGTLEELLEVITWAQLGIHRKPVGLLNVEGFYNSLLNFIDKAVDEGFISPTARRIIVSAPTAKQLVRELEEHIPECDEITSKLIWEEVEKLNYM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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