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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003732`

染色体: Chr08 坐标: 42150324-42154725 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003732`
名称	SmilChr08G003732
描述	transcription factor E2FA-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	42150324 - 42154725 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997105`
GeneID	`130997105`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997105`
原始查询	`SmilChr08G003732`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor E2FA-like
产物	transcription factor E2FA-like
Arabidopsis	`AT2G36010` (E2F3) E2F transcription factor 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818174] identity=54.8; qcov=0.975; evalue=1.3e-150; confidence=high
Rice	`Os12g0158800` (Orysa) - identity=53.8; qcov=0.913; evalue=1.94e-142; confidence=high
GO	GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0046983 (protein dimerization activity); GO:0090575 (RNA polymerase II transcription regulator complex)
KEGG	-
Pfam	PF02319 (WHD_E2F_TDP); PF16421 (E2F_CC-MB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997105

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778351.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057778351.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778351.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778351.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778351.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:42151524`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr8:42152669`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr8:42153371`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B13
`Chr8:42153371`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B13
`Chr8:42153906`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B48,B65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778351.1

481 aa

240

481

WHD_E2F_TDP

E2F_CC-MB

PF02319 WHD_E2F_TDP 155-218 aa PF16421 E2F_CC-MB 234-334 aa

XP_057778352.1

478 aa

239

478

WHD_E2F_TDP

E2F_CC-MB

PF02319 WHD_E2F_TDP 155-218 aa PF16421 E2F_CC-MB 234-334 aa

XP_057778353.1

475 aa

238

475

WHD_E2F_TDP

E2F_CC-MB

PF02319 WHD_E2F_TDP 149-212 aa PF16421 E2F_CC-MB 228-328 aa

XP_057778354.1

472 aa

236

472

WHD_E2F_TDP

E2F_CC-MB

PF02319 WHD_E2F_TDP 149-212 aa PF16421 E2F_CC-MB 228-328 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778351.1`	Pfam	`PF02319`	WHD_E2F_TDP	Domain	155	218	6.4e-27	93.8	E2F/DP family winged-helix DNA-binding domain
`XP_057778351.1`	Pfam	`PF16421`	E2F_CC-MB	Domain	234	334	7.2e-35	119.7	E2F transcription factor CC-MB domain
`XP_057778352.1`	Pfam	`PF02319`	WHD_E2F_TDP	Domain	155	218	6.4e-27	93.8	E2F/DP family winged-helix DNA-binding domain
`XP_057778352.1`	Pfam	`PF16421`	E2F_CC-MB	Domain	234	334	7.1e-35	119.7	E2F transcription factor CC-MB domain
`XP_057778353.1`	Pfam	`PF02319`	WHD_E2F_TDP	Domain	149	212	6.4e-27	93.8	E2F/DP family winged-helix DNA-binding domain
`XP_057778353.1`	Pfam	`PF16421`	E2F_CC-MB	Domain	228	328	7e-35	119.8	E2F transcription factor CC-MB domain
`XP_057778354.1`	Pfam	`PF02319`	WHD_E2F_TDP	Domain	149	212	6.3e-27	93.8	E2F/DP family winged-helix DNA-binding domain
`XP_057778354.1`	Pfam	`PF16421`	E2F_CC-MB	Domain	228	328	6.9e-35	119.8	E2F transcription factor CC-MB domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922370.1
AGTGGCTGAGGCGTTAAAGAGTGGTGAACATGGCAAGAGAAGTAATAGTTGAAGGAGCATAATGCAAAATAAATGAAATAGTCGATTTCATTTTTGGCATTTTTCTCTCCACTTCCCTCCACATCTATCCGAACCAAAATTCCCTCCCTTCCCTCCTCGTTTTCTACTCCCCCTACCCAACACGCACACACTTCACTTTCCTCCATCAAAACCCTCATTTCCCCTCTCTACCTCAGCTACTATACCCCCCCTCTCCAATT...

XM_057922368.1
TGAGGCGTTAAAGAGTGGTGAACATGGCAAGAGAAGTAATAGTTGAAGGAGCATAATGCAAAATAAATGAAATAGTCGATTTCATTTTTGGCATTTTTCTCTCCACTTCCCTCCACATCTATCCGAACCAAAATTCCCTCCCTTCCCTCCTCGTTTTCTACTCCCCCTACCCAACACGCACACACTTCACTTTCCTCCATCAAAACCCTCATTTCCCCTCTCTACCTCAGCTACTATACCCCCCCTCTCCAATTTTGATT...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130997105
ATGGCCGCGCGTGCTACTCCCAGCCGTGACGCGGCTGCTACGCCTCCTGCGGCGCCGTCGAATGTCCAGATCCTGCACCACCAGCAGACTCCTCCGCCCACGATCAGGCGCCATCTCCCCTTTGCGTCCATGAAGCCGCCGTTCGTTTCTCCCGACGACTACCACCGCTTCTCCACCCCGTCGCGCGCCGCCGCCGATCACCTCTCCGAAGCTGTAGTTATCAAGTCCTCTCCATTCAAGCGGAAGAATGGGTATCAAAA...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057778351.1
MAARATPSRDAAATPPAAPSNVQILHHQQTPPPTIRRHLPFASMKPPFVSPDDYHRFSTPSRAAADHLSEAVVIKSSPFKRKNGYQNNEVESSEWTASPVYSDIANSPFRTPVSAKGGRANSRSKVTKNNRSLPSTPISNADAPSPLTPASCRYDSSLSLLTKKFIALIKHAEDGELDLNKAADTLQVQKRRIYDITNVLEGIGLIEKKLKNRIHWKGLDSSRPGDMDKDGTLLHAEIENLSMEERSLDERIRQMQERLR...

XP_057778352.1
MAARATPSRDAAATPPAAPSNVQILHHQQTPPPTIRRHLPFASMKPPFVSPDDYHRFSTPSRAAADHLSEAVVIKSSPFKRKNGYQNNEVESSEWTASPVYSDIANSPFRTPVSAKGGRANSRSKVTKNNRSLPSTPISNADAPSPLTPASCRYDSSLSLLTKKFIALIKHAEDGELDLNKAADTLQVQKRRIYDITNVLEGIGLIEKKLKNRIHWKGLDSSRPGDMDKDGTLLHAEIENLSMEERSLDERIRQMQERLR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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