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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003748`

染色体: Chr08 坐标: 42529897-42533257 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003748`
名称	SmilChr08G003748
描述	uncharacterized SmilChr08G003748
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	42529897 - 42533257 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997116`
GeneID	`130997116`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997116`
原始查询	`SmilChr08G003748`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Expp1 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823536]; symbol=AT3G44150; hit=AT3G44150; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Expp1 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823536]; symbol=AT3G44150; hit=AT3G44150; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G44150` (AT3G44150) Expp1 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823536] identity=70.37; qcov=0.975; evalue=2.43e-126; confidence=high
Rice	`Os03g0647800` - identity=68.66; qcov=0.896; evalue=6.39e-111; confidence=high
GO	GO:0002098 (tRNA wobble uridine modification); GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol); GO:0017183 (protein histidyl modification to diphthamide); GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF28132 (DDB_G0273449)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997116

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057778358.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057778358.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057778358.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:42530391`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B46,B91,C14
`Chr8:42532546`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B109,B113,B97,C8
`Chr8:42532800`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778358.1

241 aa

120

241

DDB_G0273449

PF28132 DDB_G0273449 9-129 aa PF28132 DDB_G0273449 125-225 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778358.1`	Pfam	`PF28132`	DDB_G0273449	Domain	9	129	3.2e-39	136.4	Uncharacterised protein DDB_G0273449
`XP_057778358.1`	Pfam	`PF28132`	DDB_G0273449	Domain	125	225	3.2e-39	136.4	Uncharacterised protein DDB_G0273449

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922375.1
AGCGAGCCAATATGGCTTCAACCAGGCAGTCAAACAATAAAAGTATTGTGGCCTAAAACGAAATGCTGATAACTTGACGAACAAAGTGATAATATGTAGATAGTTGAAGGACGGAACTGCTATTCGACCCTTGATTTCAAAAGTGGAGCAAGAATCATTCAGCAACAGTCAATCAGTCCACAACCCCAAAATCACAATCTTACATAACAAATCACAGCTCATCTAATACATTGAAACCATTCGCCATTCCGAAAATGGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057778358.1_44972
ATGGCGATTCCTAGGCGATCGGTAGCTCTGCTCGTAGCTGTATTCAGCATAATCTCGTTGGTCGAATCTAGTAGCGACACGAACCGCGTGTTCTCGCCGTGCGGCGACGCGGCGGTGCAGAGGTCCGATGGGTTCACCTTCGGCATCGCCTTCTCGGCTAGAGACTCCTTCTTCTTCAACACCTCCGTTCAGCTGTCGCCGTGCGACCACCGCCTCGGGCTTGCCTCCACCGCTCAGCTCGCGGTTTTCCGCCCTAAAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778358.1
MAIPRRSVALLVAVFSIISLVESSSDTNRVFSPCGDAAVQRSDGFTFGIAFSARDSFFFNTSVQLSPCDHRLGLASTAQLAVFRPKVDEISLLTVNTSNFFPDSVGGYMVAFAGRKYAARSIPAFVANTSYIVTSFTLVHEFKKGRLQNLYWKRDGCASCSGKSNFVCLNNQDCAIRTNSCKNRGGAVDCSIGIQVAFSGTDKHESVFNSWYEVKNLRQYSLFGLYSNLRDSLTSQYNSFF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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