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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003763`

染色体: Chr08 坐标: 43049835-43053150 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003763`
名称	SmilChr08G003763
描述	uncharacterized SmilChr08G003763
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	43049835 - 43053150 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998505`
GeneID	`130998505`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998505`
原始查询	`SmilChr08G003763`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G43760` (AT1G43760) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=27.1; qcov=0.45; evalue=3.97e-28; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=25.8; qcov=0.779; evalue=1.39e-48; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998505

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779904.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057779904.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057779904.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779904.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779904.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:43049856`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	65	A18,A19,A20,A21,A3,B10,B103,B105,B109,B112,B115,B122,B133,B137,B14,B140,B16,B18,B19,B20,B22,B24,B27,B34,B4,B46,B48,B52,B58,B6,B61,B63,B64,B65,B69,B73,B76,B8,B81,B86,B9,B93,B97,C14,C18,C21,C23,C26,C35,C38,C39,C44,C46,C48,C51,C53,C54,C57,C65,C76,C81,C82,C86,C9,D6
`Chr8:43049866`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr8:43049867`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	114	A10,A13,A16,A18,A19,A20,A24,A4,A5,B101,B102,B103,B105,B106,B109,B11,B110,B112,B115,B117,B122,B124,B129,B130,B134,B136,B14,B140,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B24,B27,B3,B34,B38,B39,B4,B40,B46,B48,B52,B54,B6,B62,B63,B64,B65,B69,B71,B73,B74,B76,B77,B8,B80,B81,B82,B84,B86,B87,B89,B9,B91,B92,B93,B97,B99,C1,C12,C13,C14,C23,C24,C26,C27,C28,C3,C33,C35,C38,C39,C41,C44,C46,C48,C51,C52,C53,C54,C56,C57,C64,C65,C66,C70,C73,C74,C76,C82,C84,C86,C87,C9,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr8:43049877`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	69	A18,A19,A20,A21,A3,B10,B102,B103,B105,B109,B11,B112,B115,B122,B133,B137,B14,B140,B16,B18,B19,B20,B22,B24,B27,B34,B4,B46,B48,B52,B58,B6,B61,B63,B64,B65,B69,B73,B76,B8,B81,B86,B9,B91,B93,B97,C14,C18,C21,C23,C24,C26,C35,C38,C39,C44,C46,C48,C51,C53,C54,C57,C65,C76,C81,C82,C86,C9,D6
`Chr8:43049880`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	A15,A16,B129,B134,B45,B51,B52,B72,C10,C16,C28,C67,C70,D7
`Chr8:43049890`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	49	A15,A22,A3,A5,A9,B1,B100,B11,B111,B113,B117,B122,B126,B133,B135,B137,B139,B23,B27,B28,B35,B55,B61,B66,B67,B70,B75,B84,B89,B9,B93,C18,C2,C21,C39,C40,C44,C53,C55,C58,C61,C75,C78,C8,C80,C84,C85,D2,D7
`Chr8:43049908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B49,C11
`Chr8:43049963`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C4
`Chr8:43049971`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:43049977`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B19,B27,C56
`Chr8:43049978`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr8:43049982`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B49,C68,C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779904.1

805 aa

402

805

RVT_1

PF00078 RVT_1 406-593 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779904.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	406	593	3.7e-16	60.3	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923921.1
ATGCTCTATCATGGGGATTGTCTGCACGTTAGCTTCACTCATGCTTCCTGTGATTACACTGAGCGTCGTCAGCTCTGGCTGGATGTGGATCCTTTCATGGTAGGTCATTTTCTTATGATTGGTGATTTCAACGCGGTCTTGGGTGCTCATGAGCGTCGGGGTCGTAGAAATCTAGCTTCTAGGCCTTGCTCCGAGTTTCGTTCTTTCATTGAGGATCACGACTTGATTCAGCCTGATTCCTCTGGTCCTTTCTTTACTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998505
ATGCTCTATCATGGGGATTGTCTGCACGTTAGCTTCACTCATGCTTCCTGTGATTACACTGAGCGTCGTCAGCTCTGGCTGGATGTGGATCCTTTCATGGTAGGTCATTTTCTTATGATTGGTGATTTCAACGCGGTCTTGGGTGCTCATGAGCGTCGGGGTCGTAGAAATCTAGCTTCTAGGCCTTGCTCCGAGTTTCGTTCTTTCATTGAGGATCACGACTTGATTCAGCCTGATTCCTCTGGTCCTTTCTTTACTTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779904.1
MLYHGDCLHVSFTHASCDYTERRQLWLDVDPFMVGHFLMIGDFNAVLGAHERRGRRNLASRPCSEFRSFIEDHDLIQPDSSGPFFTWTDRRRFPSPIESVLDKALFSQDFSDVWYSASALVLPRLGSDHSPILLRCQDTASTPAGHPFRFLNMWCSHEGFLDQIRASWSSPLDYLCPMGLSLLQEGIDEQGYTDDLLDQEVSLQARIDTILLPKSEHLRQQSRVSWLSDGDRNTRFFHSMVKWRRSNQTIKKLSIDGVMS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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