Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003802`

染色体: Chr08 坐标: 43958404-43960823 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003802`
名称	SmilChr08G003802
描述	uncharacterized SmilChr08G003802
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	43958404 - 43960823 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997152`
GeneID	`130997152`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997152`
原始查询	`SmilChr08G003802`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997152

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778393.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057778393.1`
3	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057778393.1`
4	Nucleolus	核仁	0.20000	`XP_057778393.1`
5	Nucleolus rim	Nucleolus rim	0.20000	`XP_057778393.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:43960371`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	143	A1,A10,A13,A14,A15,A18,A19,A2,A21,A22,A23,A24,A4,A5,A7,B10,B100,B101,B102,B104,B106,B107,B109,B11,B112,B114,B115,B117,B119,B120,B123,B124,B125,B126,B127,B132,B133,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B15,B17,B18,B2,B20,B21,B23,B24,B25,B31,B33,B34,B35,B36,B38,B39,B40,B42,B43,B44,B46,B47,B49,B5,B50,B55,B56,B58,B59,B60,B61,B63,B64,B65,B66,B68,B7,B70,B71,B73,B76,B80,B82,B83,B84,B85,B86,B89,B9,B93,B95,B99,C1,C13,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C23,C24,C26,C27,C3,C32,C33,C35,C36,C40,C45,C47,C48,C52,C54,C55,C56,C58,C60,C61,C64,C66,C68,C7,C71,C72,C73,C74,C76,C77,C8,C84,C85,C86,C87,D3,D5,D7,D8
`Chr8:43960373`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	142	A1,A10,A13,A14,A15,A18,A19,A2,A21,A22,A23,A24,A4,A5,A7,B10,B100,B101,B102,B104,B106,B107,B109,B11,B112,B114,B115,B117,B119,B120,B123,B124,B126,B127,B132,B133,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B15,B17,B18,B2,B20,B21,B23,B24,B25,B31,B33,B34,B35,B36,B38,B39,B40,B42,B43,B44,B46,B47,B49,B5,B50,B55,B56,B58,B59,B60,B61,B63,B64,B65,B66,B68,B7,B70,B71,B73,B76,B80,B82,B83,B84,B85,B86,B89,B9,B93,B95,B99,C1,C13,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C23,C24,C26,C27,C3,C32,C33,C35,C36,C40,C45,C47,C48,C52,C54,C55,C56,C58,C60,C61,C64,C66,C68,C7,C71,C72,C73,C74,C76,C77,C8,C84,C85,C86,C87,D3,D5,D7,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922411.1
TTATATCCTGTAAAATACATTTAATAATTTTTTACATAAAAGAATGTAACGTTTGTGTTAATAGTAGGCTGATAAGATTTGAAATAATAGTAGTAATATATTAATATTAATTTGTAGAATCTAGATGGATGTGGAAGTGTCGAATGTATAGAATCCCAGTTGTAAATAGTACTAGCTCTTAATTTCGATTTTGCTTCGCCGCAAAGGAAAAGCCGTGTCATCATCCCGTGTTAGCGTTTCTCACACGGATCGATTCGATC...

XM_057922410.1
TGGAAGTGTCGAATGTATAGAATCCCAGTTGTAAATAGTACTAGCTCTTAATTTCGATTTTGCTTCGCCGCAAAGGAAAAGCCGTGTCATCATCCCGTGTTAGCGTTTCTCACACGGATCGATTCGATCCAGCTCTACAAAATCAGCTATAAAAGGTGACTCCAAATCTATCAATCTCTACGCCTTTCTTGGGAAATAATTCGTATGAGATACTAAGACATAAACAAGAAAGAGAGATTTATTGATTGGAAAATGGGGGG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130997152
ATGGGGGGCGGATCTGAAACATTTCATATTGAAGAGGAGAAGCTGGAGAAGGAAAAGATTCATTTTAGGGCTGAGAGCAAAATTGAAAAGCATGGTGAAGCAGAAGAAAAGACTAAGGTGGAGGTTGAAGTTGAAGCTAAATCAGTGGTGACAGACAAGCCAACACATGTAACGGAGAAGAAAGAAGATGAGCAGGATAAGAAGAAAGATGAGAAGGATAAAGAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGAGAAGAAATC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057778393.1
MGGGSETFHIEEEKLEKEKIHFRAESKIEKHGEAEEKTKVEVEVEAKSVVTDKPTHVTEKKEDEQDKKKDEKDKEKKKKKKKKEKKSGEESNEEVEKEKSEVEEGDEGKKKKKDKDKKHKKDKEEEDEEKKKDKEVKKKDKSSKDVEGSAGESNEENEGEGCEKEKKKKKDKKKKHKEGDREAEIQGEKELEGESEKEKKKGKGKNEDEKKKKDKMTEGKGSEGQVSEEISDEKGKEAKKKKCGKGKEEEKGKKKKSKGK...

XP_057778394.1
MGGGSETFHIEEEKLEKEKIHFRAESKIEKHGEAEEKTKVEVEVEAKSVVTDKPTHVTEKKEDEQDKKKDEKDKEKKKKKKKKEKKSGEESNEEVEKEKSEVEEGDEGKKKKKDKDKKHKKDKEEEDEEKKKDKEVKKKDKSSKDVEGSAGESNEENEGEGCEKEKKKKKDKKKKHKEGDREAEIQGEKELEGESEKEKKKGKGKNEDEKKKKDKMTEGKGSEGQVSEEISDEKGKEAKKKKCGKGKEEEKGKKKKSKGK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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