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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003809`

染色体: Chr08 坐标: 44206822-44208271 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003809`
名称	SmilChr08G003809
描述	uncharacterized SmilChr08G003809
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	44206822 - 44208271 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998521`
GeneID	`130998521`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998521`
原始查询	`SmilChr08G003809`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=25.9; qcov=0.903; evalue=2.41e-34; confidence=low
Rice	`Os12g0597300` - identity=26.1; qcov=1.07; evalue=2.38e-45; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998521

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779918.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057779918.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779918.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779918.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779918.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:44206871`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr8:44206889`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B133,B22,B55,C86,D5
`Chr8:44206901`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B55,C86
`Chr8:44206991`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	13	A22,A9,B104,B106,B11,B16,B38,B44,B57,B76,B82,C26,C5
`Chr8:44206994`	`A`	`ACG`	2bp_insertion	frameshift_variant	13	A22,A9,B104,B106,B11,B16,B38,B44,B57,B76,B82,C26,C5
`Chr8:44207087`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr8:44207093`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr8:44207121`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	B109,B135,B32,B67,B68,C30,C40,C46,C64,C66
`Chr8:44207170`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B74,C11,C69
`Chr8:44207285`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr8:44207293`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,B87,C10
`Chr8:44207322`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B1,B24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779918.1

424 aa

212

424

MULE

PF10551 MULE 64-132 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779918.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	64	132	4.9e-10	40.4	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923935.1
ATGGCGGTGGAGATAATATACGGCGGACACGAAGAATCTTATGGATTGCTACCAGGCTATCTTCACATGTTGCGGATGTGCAATCCAGGATCGGTGACCGACTTGGAAGTTGATGAGAATGATCAGTTGAAGCATCTCTTCATAGCACTTGGTTCTTGCAGAGTCGCGTACACTATGTGCATGAGGCCAATAATTGTTGTTGACGGAACACACTTGAAGGGCCGCATTAAAGGTATTTTGTTTGTTGCCGTCACAAAGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998521
ATGGCGGTGGAGATAATATACGGCGGACACGAAGAATCTTATGGATTGCTACCAGGCTATCTTCACATGTTGCGGATGTGCAATCCAGGATCGGTGACCGACTTGGAAGTTGATGAGAATGATCAGTTGAAGCATCTCTTCATAGCACTTGGTTCTTGCAGAGTCGCGTACACTATGTGCATGAGGCCAATAATTGTTGTTGACGGAACACACTTGAAGGGCCGCATTAAAGGTATTTTGTTTGTTGCCGTCACAAAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779918.1
MAVEIIYGGHEESYGLLPGYLHMLRMCNPGSVTDLEVDENDQLKHLFIALGSCRVAYTMCMRPIIVVDGTHLKGRIKGILFVAVTKDGNEQVFPIAFGIGPIENDESWKWFFYLLNEAYGQNSETLIIFDAHITVAFYQKAAYAYRESDFDKAMASLKALNEDGGAYTKLMQVGPERWARSKCPVRRYSFLTSNIAKSFNSRLLWARRLPICSMVEAIRHIIEKWFDERQEAAKTFSVNITPEALRKLTDELERSRRYEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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