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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003816`

染色体: Chr08 坐标: 44348261-44353019 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003816`
名称	SmilChr08G003816
描述	pumilio homolog 2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	44348261 - 44353019 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998524`
GeneID	`130998524`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998524`
原始查询	`SmilChr08G003816`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pumilio homolog 2-like
产物	pumilio homolog 2-like
Arabidopsis	`AT2G29190` (PUM2) pumilio 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817468] identity=33.7; qcov=1.07; evalue=1.16e-41; confidence=low
Rice	`Os01g0844800` - identity=30; qcov=1.25; evalue=1.77e-37; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07990 (NABP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998524

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779921.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057779921.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057779921.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.40000	`XP_057779921.1`
5	P-body	P-body	0.20000	`XP_057779921.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:44348720`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B74,C11,C69
`Chr8:44348980`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B86,B9,C40
`Chr8:44349004`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr8:44349063`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A7
`Chr8:44349063`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A7
`Chr8:44349065`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr8:44350450`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C30,C64,C66
`Chr8:44350454`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C30,C64,C66
`Chr8:44350483`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr8:44350551`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C87
`Chr8:44350551`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C87
`Chr8:44350553`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779921.1

444 aa

222

444

NABP

PF07990 NABP 229-323 aa PF07990 NABP 323-442 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779921.1`	Pfam	`PF07990`	NABP	Domain	229	323	2.3e-28	100.5	Nucleic acid binding protein NABP
`XP_057779921.1`	Pfam	`PF07990`	NABP	Domain	323	442	2.3e-28	100.5	Nucleic acid binding protein NABP

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923938.1
CCTTGGCTTGGCTCCTCTCTTTTCACTCTCTCCTCTATCTCTCTAAAACCCCTATAAAACTGACTTCACTCTCGCTCTCGCTCTCACTCTGATCCTTTCTCTCCGCAGAATTTAACACTTGCTCCAAACACGGACTGTTCATGGAAACAACAAGATTCGTTCTTGATTTCCTCAATTTTTTTTGTTCATCTGAAAATGTGTAACTGAAAGTGTACTGGGCTGGGCTTATTCAGATGAAATCTTGAACCCTATTTTAAGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998524
ATGATACCGGAATTGGGCGCGGGAGGTGATTATAATGAGGAGGCGGTGAGTGATCGAGGTAGGGAGCTGAGCCTTCTCCGCAGCGGCTCTGCCCCGCCGACCGTGGAGGGATCTTTGGGCGCCGCCTTTCTTGACGGCGCCGTTTCGGAGATGGAGCTGAGGTCTGATCCAGCCTACCGTTCTTATTATTACCAGAATGTGAAGCTGAACCCGCGCCTGCCGCACCCGCTTCCTAATAAAGAGGACCGCCTTATGCAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779921.1
MIPELGAGGDYNEEAVSDRGRELSLLRSGSAPPTVEGSLGAAFLDGAVSEMELRSDPAYRSYYYQNVKLNPRLPHPLPNKEDRLMQRPSGSLTFGHGGRGGGGGESLFAMQPGFGGLEEEKAMQGKWGGDRVIGYPGMGMGSKQKSIANMVQDCVGYPKTVSRHPSLMASQAFGEAESSEIHVGFHHELAPLSAVHSGTNMQSISSSTSQSYASVMGASSRNLTPDLVRSPSPRISALSGDRMSSLDQRYVNIQDLCDEI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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