当前解析结果
SmilChr08G003836| 统一新 Gene ID | SmilChr08G003836 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G003836 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G003836 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 44723984 - 44725914 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130996777 |
|---|---|
| GeneID | 130996777 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130996777 |
| 原始查询 | SmilChr08G003836 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | E3 ubiquitin-protein ligase RLIM-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831782]; symbol=SIS; hit=AT5G02020; species=arabidopsis; confidence=low |
| 产物 | E3 ubiquitin-protein ligase RLIM-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831782]; symbol=SIS; hit=AT5G02020; species=arabidopsis; confidence=low |
| Arabidopsis | AT5G02020 (SIS)E3 ubiquitin-protein ligase RLIM-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831782] identity=42.6; qcov=0.91; evalue=1.84e-15; confidence=low |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130996777 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057778065.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057778065.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057778065.1 |
| 4 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.20000 | XP_057778063.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057778065.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:44724844 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B97 |
Chr8:44724870 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A7,B135,B67,B68,C60 |
Chr8:44725734 |
A |
ATT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 127 | A1,A13,A14,A2,A21,A23,A4,A5,A8,B10,B100,B102,B103,B105,B106,B11,B112,B115,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B126,B128,B13,B130,B132,B133,B138,B14,B15,B16,B17,B20,B23,B26,B27,B28,B29,B30,B34,B37,B4,B42,B43,B47,B49,B5,B50,B53,B55,B58,B6,B60,B63,B64,B69,B7,B73,B75,B76,B77,B78,B80,B81,B87,B88,B9,B90,B92,B93,B98,C11,C12,C13,C15,C16,C17,C19,C2,C22,C23,C24,C26,C27,C30,C31,C32,C37,C38,C4,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C50,C51,C55,C58,C61,C63,C65,C68,C69,C7,C74,C75,C77,C78,C80,C81,C83,C85,C86,C9,D1,D11,D3,D5,D8,D9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
4 records
下载 cDNA FASTA4 records
下载 CDS FASTA4 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。