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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003845`

染色体: Chr08 坐标: 44795944-44796384 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003845`
名称	SmilChr08G003845
描述	uncharacterized SmilChr08G003845
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	44795944 - 44796384 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998531`
GeneID	`130998531`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998531`
原始查询	`SmilChr08G003845`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF17921 (Integrase_H2C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998531

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057779930.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057779930.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779930.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779930.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779930.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:44795949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr8:44795956`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr8:44795961`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr8:44795969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	173	A1,A11,A13,A14,A15,A18,A2,A21,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B10,B100,B101,B103,B106,B107,B11,B110,B111,B112,B113,B117,B118,B12,B120,B121,B122,B124,B125,B127,B128,B13,B130,B131,B132,B135,B139,B14,B140,B16,B2,B20,B21,B22,B24,B25,B26,B27,B31,B35,B37,B4,B42,B43,B47,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B59,B60,B62,B63,B64,B65,B66,B68,B70,B71,B73,B74,B77,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B90,B91,B92,B94,B95,B96,B97,B98,C1,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C21,C22,C24,C25,C27,C28,C30,C33,C35,C36,C37,C4,C40,C41,C43,C44,C45,C46,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C57,C58,C59,C61,C64,C65,C66,C67,C69,C71,C75,C76,C77,C8,C80,C83,C84,C85,C86,C87,D1,D10,D11,D2,D4,D5,D6,D7,D9
`Chr8:44796014`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C59,D7
`Chr8:44796030`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B69
`Chr8:44796030`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B69
`Chr8:44796033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,C20
`Chr8:44796077`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr8:44796082`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr8:44796089`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr8:44796097`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779930.1

146 aa

146

Integrase_H2C2

PF17921 Integrase_H2C2 90-140 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779930.1`	Pfam	`PF17921`	Integrase_H2C2	Domain	90	140	1.8e-12	47.9	Integrase zinc binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923947.1
ATGGCCAGCGCTGTGGACCATACTTGGACCGACTCCGTGACATTTCTATTTGAGCCCAGTGCAGAAGGTAGAGAAGCAGTTTTTAGCGTGGAAGAAAAGCCAGATTGGAGAACACCTATCATTCATTTCTTACGCACGGGCGAGCGTCTTGACGCGGTTGTATCGCAGCGCTACCTTTACTGTCGATACTGTATGCTCAATTACCAGCTCTATCGCAGGTCCTTCACACATCCACTCCTCAAGTGTCTCTCACCAGAGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998531
ATGGCCAGCGCTGTGGACCATACTTGGACCGACTCCGTGACATTTCTATTTGAGCCCAGTGCAGAAGGTAGAGAAGCAGTTTTTAGCGTGGAAGAAAAGCCAGATTGGAGAACACCTATCATTCATTTCTTACGCACGGGCGAGCGTCTTGACGCGGTTGTATCGCAGCGCTACCTTTACTGTCGATACTGTATGCTCAATTACCAGCTCTATCGCAGGTCCTTCACACATCCACTCCTCAAGTGTCTCTCACCAGAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779930.1
MASAVDHTWTDSVTFLFEPSAEGREAVFSVEEKPDWRTPIIHFLRTGERLDAVVSQRYLYCRYCMLNYQLYRRSFTHPLLKCLSPEETLYAIKEIHQGCCGNHAGYKDLMRKIVRAGFYWPTMGEDAKNFVNKCETCQKFALRIGL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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