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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003850`

染色体: Chr08 坐标: 44956014-44957559 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003850`
名称	SmilChr08G003850
描述	uncharacterized SmilChr08G003850
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	44956014 - 44957559 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998533`
GeneID	`130998533`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998533`
原始查询	`SmilChr08G003850`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998533

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779932.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779932.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057779932.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057779932.1`
5	P-body	P-body	0.20000	`XP_057779932.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:44956288`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	28	A15,A23,A25,B108,B18,B19,B2,B28,B36,B37,B38,B39,B41,B43,B56,B61,B7,B87,B94,B96,C10,C31,C37,C57,C73,C78,C79,D4
`Chr8:44956572`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,C32
`Chr8:44956583`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B130,B14,B24,B96,C76
`Chr8:44956590`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,C32
`Chr8:44956595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,C32
`Chr8:44956640`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	35	A2,A3,B12,B125,B130,B136,B14,B15,B19,B24,B39,B44,B55,B87,B96,C11,C18,C23,C25,C28,C48,C5,C55,C57,C61,C69,C74,C75,C76,C83,C85,C86,D2,D4,D7
`Chr8:44956656`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B63,C32,C68
`Chr8:44956656`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B63,C32,C68
`Chr8:44957256`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B88,C20
`Chr8:44957451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr8:44957530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B104
`Chr8:44957530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923949.1
ATGCCGGCAGACGAAGTAATAGGGTTCCAGTCATCGGAGGAGGAAACAAGCTGGCTTCGGTTTGCTTACACAGGTTATCTGAAAGAGGACTTCGTTTGGGAAGAGTTCGGAGAGGAAATTTGCAGTGAATGCGCCAATCATCTTAAAATTGCTCCGTTGGGCGGCAATCAGGTTCTCATACAAGGTACTCAACAGACCCCGATCAACGAAATCTTAAAAGACCTCGACGAGTGGTCTTCTTTTTGGTTCGAATGGCTCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998533
ATGCCGGCAGACGAAGTAATAGGGTTCCAGTCATCGGAGGAGGAAACAAGCTGGCTTCGGTTTGCTTACACAGGTTATCTGAAAGAGGACTTCGTTTGGGAAGAGTTCGGAGAGGAAATTTGCAGTGAATGCGCCAATCATCTTAAAATTGCTCCGTTGGGCGGCAATCAGGTTCTCATACAAGGTACTCAACAGACCCCGATCAACGAAATCTTAAAAGACCTCGACGAGTGGTCTTCTTTTTGGTTCGAATGGCTCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779932.1
MPADEVIGFQSSEEETSWLRFAYTGYLKEDFVWEEFGEEICSECANHLKIAPLGGNQVLIQGTQQTPINEILKDLDEWSSFWFEWLRPWSYVDMNTQRNVWTRWYGVPLRAWNSRFFNIIGAHVGRVLKIHDKTLNRLSLDIALIQVSTGLSPIDRVFECNIDGARFKIRVEEVRSSIIPEPLPEWGGCSESETETIVSASEEEFDVSHKPACAQIGTNGDKTQGLESEAGLLEVVSQPSSSPSEGDPAQPDLSLTKLCK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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