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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003851`

染色体: Chr08 坐标: 45031952-45034403 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003851`
名称	SmilChr08G003851
描述	uncharacterized SmilChr08G003851
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	45031952 - 45034403 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998534`
GeneID	`130998534`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998534`
原始查询	`SmilChr08G003851`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0850000; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os01g0850000; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G54000` (AT3G54000) TIP41-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824567] identity=30.4; qcov=0.899; evalue=8.57e-25; confidence=low
Rice	`Os01g0850000` - identity=32.1; qcov=0.886; evalue=3.63e-35; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF27723 (UCP022260)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998534

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779933.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057779933.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779933.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779933.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779933.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:45032212`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,C16,C39,C67
`Chr8:45032407`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B126,B46,C2
`Chr8:45032469`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	76	A16,A22,A5,A7,A9,B101,B110,B113,B114,B121,B124,B134,B135,B136,B21,B25,B35,B38,B39,B40,B41,B45,B46,B49,B52,B53,B54,B59,B6,B62,B66,B67,B70,B71,B75,B8,B81,B82,B83,B89,B91,C1,C10,C12,C14,C15,C25,C27,C28,C3,C32,C33,C34,C39,C40,C48,C49,C5,C52,C53,C55,C6,C63,C67,C68,C72,C76,C79,C8,C84,C85,D11,D2,D4,D5,D8
`Chr8:45032489`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B109,B63,B65,B76,B8,C51,C57
`Chr8:45032510`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	30	A7,B102,B109,B11,B114,B123,B127,B138,B139,B14,B2,B40,B44,B63,B65,B73,B76,B8,B85,B86,B9,C21,C24,C33,C40,C51,C57,C60,C61,C62
`Chr8:45032542`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	181	A10,A11,A13,A14,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A9,B1,B10,B101,B104,B106,B107,B108,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B119,B120,B121,B124,B126,B129,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B139,B140,B15,B18,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B29,B3,B31,B33,B34,B35,B36,B38,B39,B40,B41,B42,B43,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B51,B52,B53,B54,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B65,B66,B67,B70,B71,B72,B74,B75,B76,B79,B80,B81,B82,B83,B84,B86,B88,B89,B91,B93,B94,B95,B97,B99,C1,C10,C11,C12,C14,C15,C18,C19,C20,C23,C25,C26,C27,C28,C3,C32,C33,C34,C35,C39,C40,C43,C44,C45,C47,C48,C49,C5,C52,C53,C54,C55,C56,C58,C6,C61,C63,C64,C65,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C74,C75,C76,C77,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D8
`Chr8:45032544`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	180	A10,A11,A13,A14,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A9,B1,B10,B101,B104,B106,B107,B108,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B119,B120,B121,B124,B126,B129,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B139,B140,B15,B18,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B29,B3,B31,B33,B34,B35,B36,B38,B39,B40,B41,B42,B43,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B51,B52,B53,B54,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B65,B66,B67,B70,B71,B72,B74,B75,B76,B79,B80,B81,B82,B83,B84,B86,B88,B89,B91,B93,B94,B95,B97,B99,C1,C10,C11,C12,C14,C15,C18,C19,C20,C23,C25,C26,C27,C28,C3,C32,C33,C34,C35,C39,C40,C43,C44,C45,C47,C48,C49,C5,C52,C53,C54,C55,C56,C58,C6,C61,C63,C64,C65,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C74,C75,C77,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D8
`Chr8:45032957`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr8:45032965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr8:45033011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr8:45033182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr8:45033495`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779933.1

414 aa

207

414

UCP022260

PF27723 UCP022260 5-94 aa PF27723 UCP022260 126-397 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779933.1`	Pfam	`PF27723`	UCP022260	Family	5	94	1.1e-58	199.8	Uncharacterised conserved protein UCP022260
`XP_057779933.1`	Pfam	`PF27723`	UCP022260	Family	126	397	1.1e-58	199.8	Uncharacterised conserved protein UCP022260

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923950.1
TCTCTACATTGCCACTTCCCCTTTTTTCCCTCTCTGCATATTTCACTGGGCTAGGCTGGGCCCCTTAGATTTTTCCCACCATCTATAATTAAACCTTCAAGAAGCAGCAACAGCCCACAATCTGCAATCTCCGCCTTCGGCATATCTTATATATATTCATCCATACTTAAGCAGAAGCAAACTTGAGTTTCATATTGATAACAGTAATCTGGTGTTACTATGGCGCAAGAGCTTGACGATGGAGAGTTCTGGCTACCGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998534
ATGGCGCAAGAGCTTGACGATGGAGAGTTCTGGCTACCGTCGGAGTTTCTGACAGACGACGATTTGCTCATGGACTTCAAGACTGACTTCTCAAAGACCAAGAGAGGGGACGATTTTCCCCTAGGGTTTTGCAACTCGGATCTGAGCTCACCCGTTGAGTCAGTCATGGGCTCTACCGAGACCGAGAGCGACGAAGACGATTTCATCTCCGGGTTAACTCGTAAACTCGCTCATACCACACTCCACAACCCCAATTTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779933.1
MAQELDDGEFWLPSEFLTDDDLLMDFKTDFSKTKRGDDFPLGFCNSDLSSPVESVMGSTETESDEDDFISGLTRKLAHTTLHNPNFSNDHAAKVSASLTHLSLSLPLLIALFKLVFNFDRGVSYPGSPQSTLCGFKPGSSQSSPKRVSSPPESKEVIGWDLLYAAAGEVVRMRMIDETAPFRSNKPFSAPLKPASAAIPVKTPTPASAYYPPNHEAHLAFLQLQATHFQRMKQQHHMMKSGVWGQQGKMEYHQFQNQSGK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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