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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003856`

染色体: Chr08 坐标: 45103086-45103475 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003856`
名称	SmilChr08G003856
描述	uncharacterized SmilChr08G003856
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	45103086 - 45103475 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998537`
GeneID	`130998537`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998537`
原始查询	`SmilChr08G003856`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF31073 (DUF8803)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998537

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779935.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057779935.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057779935.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779935.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779935.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:45103096`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	78	A11,A14,A2,A20,A21,A3,A4,B1,B104,B106,B107,B110,B124,B129,B133,B139,B140,B19,B2,B21,B22,B23,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B33,B36,B39,B4,B41,B47,B48,B52,B55,B59,B61,B65,B7,B77,B80,B83,B84,B85,B88,B91,B94,C10,C13,C14,C16,C22,C30,C4,C48,C56,C6,C62,C64,C66,C71,C72,C73,C75,C76,C77,C78,C80,C81,C82,C83,C84,C87,D2,D6
`Chr8:45103099`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	74	A11,A14,A2,A20,A21,A3,A4,B1,B104,B106,B107,B124,B129,B139,B140,B19,B2,B21,B22,B23,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B33,B36,B39,B4,B41,B47,B48,B52,B55,B59,B61,B65,B7,B77,B80,B83,B84,B85,B88,B91,B94,C13,C16,C22,C30,C4,C48,C56,C6,C62,C64,C66,C71,C72,C73,C75,C76,C77,C78,C80,C81,C82,C83,C84,C87,D2,D6
`Chr8:45103106`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr8:45103128`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C13
`Chr8:45103128`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr8:45103137`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr8:45103176`	`TAC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	C13,C17
`Chr8:45103176`	`TAC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	C13,C17
`Chr8:45103190`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	B113,B45,B66,B8,C25,C34,C59,C63,C67,C75
`Chr8:45103198`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B129,B132,B2,C12
`Chr8:45103214`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B122,B73,B89,C51
`Chr8:45103223`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779935.1

129 aa

129

DUF8803

PF31073 DUF8803 63-109 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779935.1`	Pfam	`PF31073`	DUF8803	Domain	63	109	9.7e-08	32.5	Domain of unknown function (DUF8803)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923952.1
ATGACTGGGACAAAGGCAGGGCAAGCAATGAAGCTAGAGATCCAAGAGATCGAAGAAATCAGGAGAGAGGCATATGACAATGCTGTTCTCTACAAGGAAAGGATGAAAAAAAGCCACAATGCCTTGATCACAAACAAGCAATTCAGCTTTGGGCAAGAAGTTCTCCTGTACCAGACACGGTTCAAATTTGCACAAGGCAAGCTGAGTACCAAGTGGACCGGCCCATTTGTGGTGAAGACCCAATTCCCAAATGGAGCCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998537
ATGACTGGGACAAAGGCAGGGCAAGCAATGAAGCTAGAGATCCAAGAGATCGAAGAAATCAGGAGAGAGGCATATGACAATGCTGTTCTCTACAAGGAAAGGATGAAAAAAAGCCACAATGCCTTGATCACAAACAAGCAATTCAGCTTTGGGCAAGAAGTTCTCCTGTACCAGACACGGTTCAAATTTGCACAAGGCAAGCTGAGTACCAAGTGGACCGGCCCATTTGTGGTGAAGACCCAATTCCCAAATGGAGCCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779935.1
MTGTKAGQAMKLEIQEIEEIRREAYDNAVLYKERMKKSHNALITNKQFSFGQEVLLYQTRFKFAQGKLSTKWTGPFVVKTQFPNGAVEIGNPKSGKVFKVNGQRLKAYYGHKPDAGEELDLDPATSTLD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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