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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003860`

染色体: Chr08 坐标: 45311669-45313487 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003860`
名称	SmilChr08G003860
描述	uncharacterized SmilChr08G003860
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	45311669 - 45313487 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996774`
GeneID	`130996774`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996774`
原始查询	`SmilChr08G003860`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Nuclear transport factor 2 (NTF2) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820081]; symbol=AT3G09250; hit=AT3G09250; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Nuclear transport factor 2 (NTF2) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820081]; symbol=AT3G09250; hit=AT3G09250; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G09250` (AT3G09250) Nuclear transport factor 2 (NTF2) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820081] identity=60.6; qcov=0.789; evalue=3.14e-89; confidence=high
Rice	`Os02g0788500` - identity=65; qcov=0.689; evalue=2.53e-87; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF02151 (UVR); PF08332 (CaMKII_AD); PF13474 (SnoaL_3); PF14534 (DUF4440)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996774

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057778058.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057778058.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778058.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778058.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778058.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:45312632`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,C53,C8,D5
`Chr8:45312638`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778058.1

270 aa

135

270

UVR

CaMKII_AD

SnoaL_3

DUF4440

PF02151 UVR 116-145 aa PF08332 CaMKII_AD 150-266 aa PF13474 SnoaL_3 151-268 aa PF14534 DUF4440 152-258 aa

XP_057778059.1

270 aa

135

270

UVR

CaMKII_AD

SnoaL_3

DUF4440

PF02151 UVR 116-145 aa PF08332 CaMKII_AD 150-266 aa PF13474 SnoaL_3 151-268 aa PF14534 DUF4440 152-258 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778058.1`	Pfam	`PF02151`	UVR	Family	116	145	1.7e-05	25.2	UvrB/uvrC motif
`XP_057778058.1`	Pfam	`PF08332`	CaMKII_AD	Domain	150	266	9.2e-05	23.3	Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association domain
`XP_057778058.1`	Pfam	`PF13474`	SnoaL_3	Domain	151	268	1.4e-23	84.2	SnoaL-like domain
`XP_057778058.1`	Pfam	`PF14534`	DUF4440	Domain	152	258	8e-07	30.2	Domain of unknown function (DUF4440)
`XP_057778059.1`	Pfam	`PF02151`	UVR	Family	116	145	1.7e-05	25.2	UvrB/uvrC motif
`XP_057778059.1`	Pfam	`PF08332`	CaMKII_AD	Domain	150	266	9.2e-05	23.3	Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association domain
`XP_057778059.1`	Pfam	`PF13474`	SnoaL_3	Domain	151	268	1.4e-23	84.2	SnoaL-like domain
`XP_057778059.1`	Pfam	`PF14534`	DUF4440	Domain	152	258	8e-07	30.2	Domain of unknown function (DUF4440)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922075.1
GAAATGAAGCCCATTATTAAGCCCACTATGACAGCCCGGATTAAGAACTCCGTCCAATCCAACGGTCGAGTTTTCATTTCAAGCGCGGTTTATGCAGCTACTCCCTAATTGTTCTTGTTCATCATCAATCCATCTCTCGTTTTCTCTCCTACCAGTCAACGACTGGCGAGATCTTTGCTGCCATGGAGGCGTCAAATTTTTCCGCGATGTATTTCAAGCCCCAGCTGAACCGAGCTAGTTTATTCAGGGATGCAAAAGAT...

XM_057922076.1
CCAAATTCCTCCTTATCAATTCCACCGGGATTTTTCCCTCTAGAAATCATGCTTCCGCTATGCATTCCTCGGTGTTTCGTTCTGTAATAATCACTCGTTTAATTTTCTCTCTTCTCGGCAGCTGGCGAGATCTTTGCTGCCATGGAGGCGTCAAATTTTTCCGCGATGTATTTCAAGCCCCAGCTGAACCGAGCTAGTTTATTCAGGGATGCAAAAGATGCTGTACTGTTGGATTGCAGAGAACATAGGCATTTACCTGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130996774
ATGGAGGCGTCAAATTTTTCCGCGATGTATTTCAAGCCCCAGCTGAACCGAGCTAGTTTATTCAGGGATGCAAAAGATGCTGTACTGTTGGATTGCAGAGAACATAGGCATTTACCTGGATTCTGCACAAACAGTCTTCGTGCTCGTCCTCACAGGCTAAACAATGTGGTTTTGGGTGGAAATGCTGGTGTAGAACCTAAATTTCAACCTATTTCCAGTGGTCGAACTTCACGAGCAGTACATTTGGTGCAAGGATCAAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057778058.1
MEASNFSAMYFKPQLNRASLFRDAKDAVLLDCREHRHLPGFCTNSLRARPHRLNNVVLGGNAGVEPKFQPISSGRTSRAVHLVQGSRSRLLVSCQVTREESGGTMSGESILLNEQTLERELQLAIEEENYAQAAKIRDSLRLLQEDSKASVLAANARFYNSFRNGDLASMQALWSKGNHVCVVHPGVSGISGYDLVMGSWEFVWADYEFPLEIEIKDVQVHVRGDVGYVTCIEMVKTKGSSWGRHFASNVFEKVDGRWFI...

XP_057778059.1
MEASNFSAMYFKPQLNRASLFRDAKDAVLLDCREHRHLPGFCTNSLRARPHRLNNVVLGGNAGVEPKFQPISSGRTSRAVHLVQGSRSRLLVSCQVTREESGGTMSGESILLNEQTLERELQLAIEEENYAQAAKIRDSLRLLQEDSKASVLAANARFYNSFRNGDLASMQALWSKGNHVCVVHPGVSGISGYDLVMGSWEFVWADYEFPLEIEIKDVQVHVRGDVGYVTCIEMVKTKGSSWGRHFASNVFEKVDGRWFI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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