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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003863`

染色体: Chr08 坐标: 45540391-45541131 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003863`
名称	SmilChr08G003863
描述	uncharacterized SmilChr08G003863
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	45540391 - 45541131 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998540`
GeneID	`130998540`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998540`
原始查询	`SmilChr08G003863`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0315200` - identity=31.9; qcov=0.687; evalue=4.67e-22; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid); PF19259 (Ty3_capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998540

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779939.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057779939.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057779939.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057779939.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779939.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:45540417`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C82
`Chr8:45540417`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C82
`Chr8:45540452`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B86,B9,C40
`Chr8:45540493`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A14,B21,B31,B47,B59,B83,C56
`Chr8:45540507`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B86,B9,C40
`Chr8:45540508`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B51,B52,B53,B72,C83
`Chr8:45540530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B68
`Chr8:45540567`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C65
`Chr8:45540622`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C23
`Chr8:45540622`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr8:45540637`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B107,B117,C28,D2
`Chr8:45540647`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	13	A18,B1,B111,B140,B24,B35,B48,B50,C1,C29,C30,C49,C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779939.1

246 aa

123

246

PEG10_N-capsid

Ty3_capsid

PF03732 PEG10_N-capsid 37-108 aa PF19259 Ty3_capsid 38-196 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779939.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	37	108	2.2e-10	41.5	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain
`XP_057779939.1`	Pfam	`PF19259`	Ty3_capsid	Domain	38	196	6e-07	29.8	Ty3 transposon capsid-like protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923956.1
ATGCTTCCGAGATGCAACCAAGGGCGTTATTTTGATGATAGGCGGGAAAATACTCCCCCGCCACCGCCGCAACCTGAGAGGAGAATCGAAGAACTTTTTCTTCGACAAAATCCACCCGGATTTAGTGGGACTGGAAGTCCACAAGAGGCAGAAGATTGGGTTAGAGCTTTGGAGATGATCTTTAAGTTCCTCAGGTGTAATGACCAGGAGAGGATGTTGTGCATGTCCTTCCAACTAACCGGATCAGCCGATTACTGGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998540
ATGCTTCCGAGATGCAACCAAGGGCGTTATTTTGATGATAGGCGGGAAAATACTCCCCCGCCACCGCCGCAACCTGAGAGGAGAATCGAAGAACTTTTTCTTCGACAAAATCCACCCGGATTTAGTGGGACTGGAAGTCCACAAGAGGCAGAAGATTGGGTTAGAGCTTTGGAGATGATCTTTAAGTTCCTCAGGTGTAATGACCAGGAGAGGATGTTGTGCATGTCCTTCCAACTAACCGGATCAGCCGATTACTGGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779939.1
MLPRCNQGRYFDDRRENTPPPPPQPERRIEELFLRQNPPGFSGTGSPQEAEDWVRALEMIFKFLRCNDQERMLCMSFQLTGSADYWWEARQKTLTPEQIENYTWEQSKTTLFEKYVPRSYREQREAEFGNLRQGKKSVAEYDREFCDLSRFAPQKVDTDEKMSELFCAGLRQDIRVVLESQATLPYTEALNRALDMELAMQPEKALQAPAPPLTQTKIPGGQQTAPPAQTGKRKWEDRGQGNRTPW

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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