当前解析结果
SmilChr08G003871| 统一新 Gene ID | SmilChr08G003871 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G003871 |
| 描述 | mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM10 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 45789266 - 45791680 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130996781 |
|---|---|
| GeneID | 130996781 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130996781 |
| 原始查询 | SmilChr08G003871 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM10 |
| 产物 | mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM10 |
| Arabidopsis | AT2G29530 (TIM10)Tim10/DDP family zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817502] identity=63.4; qcov=0.976; evalue=1.55e-36; confidence=medium |
| Rice | Os03g0825400- identity=76.2; qcov=1; evalue=5.26e-45; confidence=medium |
| GO | GO:0005743 (mitochondrial inner membrane); GO:0045039 (protein insertion into mitochondrial inner membrane) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF02953 (zf-Tim10_DDP) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130996781 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057778073.1 |
| 2 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 0.80000 | XP_057778073.1 |
| 3 | Mitochondrion inner membrane | 线粒体内膜 | 0.80000 | XP_057778073.1 |
| 4 | Mitochondrion intermembrane space | Mitochondrion intermembrane space | 0.40000 | XP_057778073.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057778073.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:45790227 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr8:45790246 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr8:45790453 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B22,C14 |
Chr8:45790791 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057778073.1PF02953
zf-Tim10_DDP 18-77 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057778073.1 |
Pfam | PF02953 |
zf-Tim10_DDP | Domain | 18 | 77 | 1.2e-21 | 76.7 | Tim10/DDP family zinc finger |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。