当前解析结果
SmilChr08G003873| 统一新 Gene ID | SmilChr08G003873 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G003873 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G003873 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 45850184 - 45850567 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130998543 |
|---|---|
| GeneID | 130998543 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998543 |
| 原始查询 | SmilChr08G003873 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998543 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057779940.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057779940.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057779940.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057779940.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057779940.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:45850189 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A1,A8,B4,C38 |
Chr8:45850203 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B58 |
Chr8:45850225 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A19,B42,B51,D4 |
Chr8:45850240 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A19,B51,C60 |
Chr8:45850244 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B117,C31,C38,C65 |
Chr8:45850252 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A23,B29,B65,B67,C30 |
Chr8:45850264 |
G |
GCA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 20 | A21,A24,A8,B101,B133,B134,B16,B37,B42,B43,B44,B69,B94,C51,C58,C65,C75,C79,C80,D9 |
Chr8:45850273 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B12 |
Chr8:45850277 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A15,B4,B85,C52 |
Chr8:45850295 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C76 |
Chr8:45850305 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 80 | A13,A14,A16,A21,A3,B1,B101,B107,B11,B113,B118,B124,B126,B128,B131,B134,B135,B137,B139,B17,B19,B21,B29,B3,B40,B42,B46,B49,B50,B54,B59,B6,B61,B63,B67,B68,B7,B70,B72,B75,B76,B77,B8,B83,B98,C11,C12,C16,C21,C23,C28,C30,C31,C32,C39,C43,C45,C47,C49,C5,C50,C51,C52,C56,C57,C6,C63,C65,C71,C72,C74,C77,C78,C79,C84,D1,D10,D3,D5,D7 |
Chr8:45850323 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 5 | B52,B64,C19,C46,C7 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。