当前解析结果
SmilChr08G003874| 统一新 Gene ID | SmilChr08G003874 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G003874 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G003874 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 45851171 - 45851815 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130998544 |
|---|---|
| GeneID | 130998544 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998544 |
| 原始查询 | SmilChr08G003874 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998544 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057779941.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 1.00000 | XP_057779941.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.80000 | XP_057779941.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.20000 | XP_057779941.1 |
| 5 | Nuclear body | 核内小体 | 0.20000 | XP_057779941.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:45851195 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B2 |
Chr8:45851237 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B41,B71,B89,C70 |
Chr8:45851252 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 8 | A3,B104,B133,B22,B27,B4,C48,D6 |
Chr8:45851271 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B56,B96,C40,D4 |
Chr8:45851337 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B26,B51 |
Chr8:45851354 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 6 | A13,B34,B76,B95,C20,C26 |
Chr8:45851356 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B115,B131,C25 |
Chr8:45851357 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 8 | B41,B51,B53,B71,B89,C10,C70,C83 |
Chr8:45851363 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B13,D11 |
Chr8:45851385 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B26,B51 |
Chr8:45851394 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A21 |
Chr8:45851399 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B124,C52 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。