当前解析结果
SmilChr08G003875| 统一新 Gene ID | SmilChr08G003875 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G003875 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G003875 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 45910591 - 45911382 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130998545 |
|---|---|
| GeneID | 130998545 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998545 |
| 原始查询 | SmilChr08G003875 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998545 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057779942.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 1.00000 | XP_057779942.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 1.00000 | XP_057779942.1 |
| 4 | Nuclear body | 核内小体 | 0.40000 | XP_057779942.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.20000 | XP_057779942.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:45910602 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C67,C81 |
Chr8:45910607 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C67,C81 |
Chr8:45910622 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr8:45910630 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 8 | A15,B108,B56,B96,C16,C33,C39,D4 |
Chr8:45910634 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A16 |
Chr8:45910635 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B115,B134,B28,B75,C87 |
Chr8:45910638 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C49 |
Chr8:45910649 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B24,B9 |
Chr8:45910650 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B88,C53,C83 |
Chr8:45910660 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A14,B85 |
Chr8:45910690 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B88,C83 |
Chr8:45910696 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B129,B17,B2,B49 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。